胚胎停育原因多样，包括染色体因素（父母或胚胎自身染色体异常）、母体因素（内分泌、子宫、免疫、全身性疾病等）、父亲因素（精子质量问题）、环境因素（化学物质、放射性物质接触）。
一、染色体因素
父母染色体异常：父母双方任何一方存在染色体数目或结构的异常，都可能遗传给胚胎，导致胚胎染色体异常，从而引发胚胎停育。例如，平衡易位携带者，其携带的异常染色体传递给胚胎后，会干扰胚胎正常的发育进程。从年龄角度看，女性年龄越大，卵子质量下降，染色体发生异常的概率增加；男性随着年龄增长，精子质量也可能出现问题，染色体异常几率上升。
胚胎自身染色体异常：在胚胎发育过程中，由于各种内外因素影响，如接触放射性物质、化学毒物等，导致胚胎自身染色体发生突变，这是早期胚胎停育最常见的原因之一，约占50%-60%。
二、母体因素
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素对于维持子宫内膜蜕膜化、保障胚胎着床和发育至关重要。若黄体功能不全，孕激素分泌不足，子宫内膜容受性下降，无法为胚胎提供良好的着床和发育环境，易导致胚胎停育。研究表明，黄体功能不全的女性胚胎停育发生率明显高于正常女性。
甲状腺功能异常：甲状腺激素参与机体的新陈代谢、生长发育等多个过程，与胚胎的生长发育密切相关。甲状腺功能减退时，机体内分泌紊乱，会影响胚胎的神经发育等；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常发育，增加胚胎停育风险。
子宫因素
子宫解剖结构异常：如子宫畸形，像单角子宫、双角子宫等，子宫腔形态异常，胚胎着床后空间受限，影响胚胎的血供和发育；子宫内膜息肉会影响子宫内膜的容受性，阻碍胚胎着床；宫腔粘连会使子宫内膜面积减少，不利于胚胎种植和发育，这些都可能导致胚胎停育。
子宫内膜病变：子宫内膜炎会破坏子宫内膜的正常结构和功能，炎性因子会影响胚胎的着床和发育；子宫内膜过薄或过厚也不利于胚胎着床，例如多次人工流产导致子宫内膜损伤变薄，胚胎难以着床或着床后易发生停育。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，机体产生自身抗体，攻击胚胎组织，导致胚胎停育。自身抗体可通过多种途径影响胎盘的血液循环和免疫调节，破坏胚胎的正常发育环境。
同种免疫异常：母体对胚胎免疫耐受异常，母体免疫系统将胚胎视为“异物”进行攻击，引发免疫排斥反应，从而导致胚胎停育。例如母胎界面免疫平衡失调，自然杀伤细胞活性过高等情况都可能参与其中。
全身性疾病：孕妇患有严重的全身性疾病，如严重的糖尿病未控制好血糖，高血糖环境不利于胚胎发育；严重的高血压，会影响胎盘的血流灌注，导致胚胎缺血缺氧，进而引发胚胎停育；感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒等，可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎发育导致停育。
三、父亲因素
精子质量问题：精子染色体异常、精子DNA完整性受损等会影响胚胎的质量。例如，精子DNA碎片率高时，胚胎发育潜力下降，增加胚胎停育的风险。男性长期接触不良环境因素，如高温、辐射、化学毒物等，会影响精子质量，进而影响胚胎发育。
四、环境因素
化学物质接触：孕妇接触过多的有机溶剂、重金属（如铅、汞等）、农药等化学物质，这些物质可通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎的正常代谢和发育过程，导致胚胎停育。例如长期处于装修新家具散发有害化学物质的环境中，增加胚胎停育风险。
放射性物质接触：孕妇接触过量的放射性物质，如X射线等，会导致胚胎细胞受损，染色体畸变，从而引发胚胎停育。例如在没有做好防护措施的情况下进行放射性检查或处于放射性工作环境中。
