乳管内乳头状瘤的发生与内分泌因素（雌激素水平异常增高、孕激素相对不足）、导管上皮异常增生（先天性导管发育异常、后天性导管损伤与修复）、其他因素（年龄因素、生活方式因素、疾病史因素）相关。
一、内分泌因素
1.雌激素水平相关
乳管内乳头状瘤的发生与雌激素水平异常增高有一定关系。正常情况下，乳腺组织的生长、发育和维持受到体内激素平衡的调控。当雌激素水平相对过高时，会刺激乳腺导管上皮细胞过度增生。例如，在一些处于高雌激素状态的生理阶段，如青春期、妊娠期等，女性体内雌激素水平波动较大，可能增加患乳管内乳头状瘤的风险。研究表明，雌激素可以通过与乳腺导管上皮细胞上的雌激素受体结合，促进细胞的有丝分裂，从而导致导管内乳头状瘤的形成。
对于长期口服避孕药的女性，由于药物中含有的雌激素成分可能影响体内激素平衡，也可能使患乳管内乳头状瘤的几率有所增加。
2.孕激素相对不足
孕激素在维持乳腺组织的正常生理功能中也起着重要作用。当孕激素水平相对不足时，会打破雌激素与孕激素之间的平衡。乳腺导管上皮细胞在雌激素的持续刺激下，而缺乏孕激素的对抗作用，就容易发生异常增生，进而引发乳管内乳头状瘤。例如，一些围绝经期女性，由于卵巢功能逐渐衰退，孕激素分泌减少，可能处于雌激素相对优势的状态，增加了患乳管内乳头状瘤的可能性。
二、导管上皮异常增生
1.先天性导管发育异常
部分患者可能存在先天性的乳腺导管发育异常情况。胚胎发育时期，乳腺导管的形成过程中出现偏差，导致导管结构和功能异常。这种先天性的异常可能使得导管上皮细胞更容易发生增生性改变。例如，某些患者的乳腺导管在胚胎期就存在形态上的缺陷，随着年龄增长，在各种因素刺激下，更容易发展为乳管内乳头状瘤。
先天性导管发育异常可能在家族遗传因素的基础上发生，虽然具体的遗传机制尚不完全明确，但有研究发现某些家族中乳管内乳头状瘤的发病率相对较高，提示可能存在一定的遗传易感性与先天性导管发育异常相关联。
2.后天性导管损伤与修复
乳腺导管在后天受到一些损伤后，如外伤、炎症等，会启动修复机制。在修复过程中，如果修复过程出现异常，可能导致导管上皮细胞过度增生。例如，乳腺导管发生慢性炎症时，炎症刺激会引起导管上皮细胞的反复损伤和修复，在修复过程中，细胞的增殖调控失衡，就可能逐渐形成乳管内乳头状瘤。长期的乳头乳晕区的慢性炎症刺激，如乳头湿疹样改变长期不愈等情况，都可能影响导管上皮的正常状态，增加乳管内乳头状瘤的发生风险。
三、其他因素
1.年龄因素
乳管内乳头状瘤好发于40-50岁的女性。随着年龄的增长，乳腺组织逐渐发生生理性变化，内分泌调节功能逐渐减退，导管上皮细胞的增殖调控能力下降。在40-50岁这个年龄段，女性体内激素水平的波动和内分泌失调的情况相对更常见，使得该年龄段女性患乳管内乳头状瘤的几率相对较高。例如，与年轻女性相比，该年龄段女性乳腺导管上皮细胞更容易受到各种因素的影响而发生异常增生。
2.生活方式因素
长期的不良生活方式也可能对乳管内乳头状瘤的发生有一定影响。例如，长期精神压力过大的女性，会影响体内内分泌系统的平衡，导致激素分泌紊乱。精神压力可通过下丘脑-垂体-性腺轴等途径影响雌激素和孕激素的分泌，使得乳腺导管上皮细胞的生长调节失衡。另外，长期高脂肪、高糖饮食的女性，可能会导致体内雌激素水平升高，因为高脂肪饮食可以促进体内雌激素的合成，从而增加患乳管内乳头状瘤的风险。缺乏运动的女性，身体代谢功能下降，也可能影响激素的代谢和乳腺组织的正常生理状态，增加患病几率。
3.疾病史因素
有乳腺其他良性疾病病史的女性，如乳腺囊性增生病等，患乳管内乳头状瘤的风险相对较高。因为乳腺囊性增生病本身就是乳腺导管和腺泡的增生性疾病，与乳管内乳头状瘤的发病机制有一定的相似性，都涉及导管上皮的异常增生。另外，有乳腺外伤史且恢复不佳的女性，乳腺组织的局部微环境发生改变，也可能为乳管内乳头状瘤的发生创造条件。
