胚胎停孕受多种因素影响，包括染色体异常（夫妻一方染色体数目或结构异常，女性年龄增长致卵子染色体异常几率增加，男性年龄增长精子染色体可能突变）、内分泌因素（黄体功能不全致孕酮不足、甲状腺功能异常、糖尿病血糖控制不佳）、子宫因素（子宫解剖结构异常如畸形、粘连，子宫肌瘤）、免疫因素（自身免疫性疾病相关抗体异常、同种免疫异常）、感染因素（TORCH感染及其他细菌、病毒感染）、生活方式因素（吸烟饮酒、过度劳累）及其他因素（环境因素、男性精子质量问题）。
年龄因素影响：随着女性年龄的增长，卵子质量下降，染色体发生异常的几率会增加。女性35岁以后，卵子染色体异常的概率明显上升，这也就导致了该年龄段胚胎停孕的风险相对较高；男性随着年龄增长，精子的染色体也可能出现突变等异常情况，从而影响胚胎发育。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持子宫内膜容受性和胚胎着床及发育至关重要。如果黄体功能不全，就会导致孕酮分泌不足，使得子宫内膜不能很好地转化，无法为胚胎着床提供良好的内环境，进而增加胚胎停孕的风险。例如，临床研究发现，黄体功能不全的女性发生胚胎停孕的概率比黄体功能正常的女性要高不少。
甲状腺功能异常：甲状腺激素对胚胎的生长发育起着不可或缺的调节作用。甲状腺功能减退时，体内甲状腺激素水平降低，会影响胚胎的代谢、细胞分化等过程；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常发育。无论是甲状腺功能亢进还是减退，都可能引发胚胎停孕。有相关研究统计，甲状腺功能异常的孕妇发生胚胎停孕的风险较甲状腺功能正常的孕妇显著升高。
糖尿病：患有糖尿病的孕妇，如果血糖控制不佳，高血糖环境会影响胚胎的发育。高血糖可通过胎盘影响胚胎的代谢，导致胚胎细胞生长分化异常等，从而增加胚胎停孕的可能性。例如，未良好控制血糖的妊娠糖尿病患者，胚胎停孕的发生率明显高于血糖控制良好的患者。
子宫因素
子宫解剖结构异常
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等。子宫畸形会使子宫腔的形态发生改变，影响胚胎的着床和生长空间。以纵隔子宫为例，纵隔的存在会占据部分宫腔空间，干扰胚胎的正常着床和发育，导致胚胎停孕的风险增加。有研究显示，子宫畸形患者发生胚胎停孕的概率明显高于子宫形态正常的女性。
宫腔粘连：多由于宫腔操作（如人工流产、刮宫等）、感染等原因引起，宫腔粘连会使宫腔容积减小，子宫内膜受损，影响胚胎的种植和发育。例如，有过多次宫腔操作史的女性，发生宫腔粘连的几率较高，进而胚胎停孕的风险也相应升高。
子宫肌瘤：较大的子宫肌瘤或者位置特殊的子宫肌瘤（如黏膜下子宫肌瘤）可能会影响子宫的血液循环，干扰胚胎的着床和发育。黏膜下子宫肌瘤会像异物一样存在于宫腔内，阻碍胚胎的种植，并且可能影响局部的血流供应，导致胚胎得不到充足的营养供应而停孕。研究发现，子宫肌瘤直径大于5cm的孕妇，胚胎停孕的发生率相对较高。
免疫因素
自身免疫性疾病相关抗体异常：如抗心磷脂抗体阳性等。抗心磷脂抗体可通过影响胎盘血管的血栓形成，导致胎盘血流灌注不足，进而影响胚胎的营养供应，引起胚胎停孕。有研究表明，抗心磷脂抗体阳性的孕妇发生胚胎停孕的风险明显高于抗体阴性的孕妇。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受异常也可能导致胚胎停孕。正常情况下，母体免疫系统应对胚胎时应处于一种耐受状态，以允许胚胎在子宫内生长发育。但如果这种免疫耐受失衡，母体免疫系统将胚胎识别为“异物”并进行攻击，就会引发胚胎停孕。例如，一些原因导致母体封闭抗体缺乏等情况，就可能出现同种免疫异常，增加胚胎停孕的风险。
感染因素
TORCH感染：包括弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等感染。孕妇在孕期感染这些病原体后，病原体可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎的正常发育，导致胚胎停孕。例如，孕妇感染风疹病毒后，尤其是在妊娠早期，胚胎受感染后可能出现发育畸形、停孕等情况。有研究统计，孕期发生TORCH感染的孕妇，胚胎停孕的发生率较未感染孕妇明显升高。
其他细菌、病毒感染：如孕期发生支原体、衣原体感染等，也可能影响胚胎的生长环境，导致胚胎停孕。例如，支原体感染可引起子宫内环境的改变，干扰胚胎的着床和发育过程，从而增加胚胎停孕的风险。
生活方式因素
吸烟饮酒：孕妇吸烟会摄入尼古丁等有害物质，这些物质可通过胎盘进入胚胎体内，影响胚胎的血管收缩，减少胎盘血流，阻碍胚胎的营养供应和氧气输送，进而影响胚胎发育，增加胚胎停孕的风险。而过量饮酒，酒精会通过胎盘影响胚胎的细胞分裂、分化等过程，导致胚胎发育异常，引发胚胎停孕。有相关调查显示，吸烟饮酒的孕妇发生胚胎停孕的概率远高于不吸烟不饮酒的孕妇。
过度劳累：孕期过度劳累会使孕妇身体处于应激状态，体内激素水平可能出现波动，影响胚胎的正常发育环境。长期处于过度劳累状态的孕妇，身体的免疫力可能下降，也更容易受到各种不良因素的影响，从而增加胚胎停孕的可能性。
其他因素
环境因素：长期接触一些有毒有害物质，如苯、甲醛等化学物质，或者处于高辐射环境中（如长期接触X射线等），这些环境因素可能会损伤胚胎的细胞，影响胚胎的正常发育，导致胚胎停孕。例如，在化工行业长期工作且防护不当的孕妇，接触有毒化学物质的机会较多，胚胎停孕的风险相对较高。
男性因素：除了染色体异常外，男性的精子质量也与胚胎停孕有关。精子的活力低下、畸形率高等情况会影响受精过程以及受精卵的质量，从而增加胚胎停孕的风险。例如，有研究发现，精子畸形率超过一定比例时，胚胎停孕的发生率会明显上升。
