小儿败血症的死亡率受到多种因素的影响，难以给出一个确切的数值。一般而言，在发达国家，小儿败血症总体死亡率大约在10%-20%。在发展中国家，由于医疗资源相对有限、诊断和治疗的及时性及有效性不足等原因，死亡率可能会达到30%-50%，甚至更高。影响小儿败血症死亡率的因素为年龄、基础疾病、病原菌种类。
1.年龄
新生儿尤其是早产儿，由于免疫系统发育不完善，身体各器官功能不成熟，抵抗力较差，发生败血症后死亡率相对较高，可达20%-30%。随着年龄增长，免疫系统逐渐发育完善，死亡率会有所降低。
2.基础疾病
如果小儿本身存在先天性心脏病、肺部发育不良、免疫缺陷病等基础疾病，发生败血症时病情往往更为严重，死亡率也会显著升高。例如，患有先天性心脏病的小儿，败血症可能导致心脏功能进一步受损，增加治疗难度和死亡风险。
3.病原菌种类
不同病原菌引起的败血症死亡率有所不同。例如，耐药菌如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、泛耐药鲍曼不动杆菌等引起的败血症，由于治疗药物选择有限，治疗效果不佳，死亡率较高。而一些对常用抗生素敏感的病原菌引起的败血症，经过及时有效的治疗，死亡率相对较低。
