1.疼痛
这是男性肾结石最常见的症状之一，疼痛程度和性质取决于结石的大小、位置以及是否引起梗阻等。较大的结石在肾盂或肾盏内移动度较小时，多表现为腰部酸胀不适，或在身体活动增加时有隐痛或钝痛。较小的结石在肾盂或输尿管内移动，引起输尿管痉挛时，可出现严重的肾绞痛。肾绞痛常突然发作，疼痛剧烈，如刀割样，可从腰部或上腹部向下放射至下腹部、腹股沟、大腿内侧，部分患者还会伴有恶心、呕吐等症状。
2.血尿
血尿也是男性肾结石的重要症状，通常是由于结石在肾脏内移动，擦伤肾盂或输尿管黏膜，导致黏膜破损出血。血尿可分为肉眼血尿和镜下血尿。肉眼血尿时，尿液呈洗肉水样或含有血丝、血块；镜下血尿则需要通过显微镜检查才能发现尿液中的红细胞。一般来说，疼痛和血尿相继出现是肾和输尿管结石的特点，尤其是体力活动较多时，如劳动、运动、骑马和乘车时突然发生疼痛和血尿。
3.排尿异常
部分患者可能出现排尿困难、尿流中断等症状，因为结石如果位于输尿管膀胱开口处或进入膀胱，可能会阻塞尿路，影响尿液的正常排出。另外，患者还可能出现尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，特别是合并感染时，这些症状会更加明显。
4.发热
当肾结石合并感染时，患者可能会出现发热症状，感染可由结石梗阻导致尿液引流不畅，细菌滋生引起。发热程度可轻可重，严重时可出现寒战、高热，体温可达39℃甚至更高。同时，患者还可能伴有全身乏力、食欲不振等全身症状。
