畸胎瘤的发生与多种因素相关，包括胚胎期生殖细胞异常分化、遗传因素影响（存在家族遗传倾向且不同性别遗传易感性有差异）、内分泌因素作用（激素水平异常影响，不同年龄阶段因内分泌状态不同发生概率有特点）、环境因素干扰（长期暴露于环境污染物质，不同生活方式人群接触程度不同风险有差异）以及免疫因素异常（免疫功能失调时无法及时清除异常分化生殖细胞，不同健康状况人群及儿童免疫功能不同影响不同）。
一、生殖细胞异常分化
胚胎期因素：在胚胎发育早期，生殖细胞会发生迁移等过程。如果在这个过程中，部分生殖细胞出现异常分化，就有可能形成畸胎瘤。胚胎期原始生殖细胞在游走过程中，可能会停留在身体的某些特殊部位，并且异常增殖分化，逐渐形成含有多种组织成分的畸胎瘤。例如，卵巢和睾丸是畸胎瘤的好发部位，这与生殖细胞正常的迁移路径相关，若生殖细胞在迁移过程中出现异常停留并增殖分化，就可能在相应部位形成畸胎瘤。
二、遗传因素影响
家族遗传倾向：某些遗传综合征与畸胎瘤的发生有关。比如，皮-杰综合征（Peutz-Jegherssyndrome）患者发生卵巢畸胎瘤的风险可能增加。研究发现，这类遗传综合征存在特定的基因变异，这些基因变异会影响细胞的正常分化和生长调控，使得个体更容易出现生殖细胞的异常分化，进而引发畸胎瘤。不同性别在遗传易感性上可能存在一定差异，因为不同性别的生殖系统发育和相关基因的表达等存在不同特点，所以在相同遗传背景下，男性和女性发生畸胎瘤的部位和概率可能有所不同。
三、内分泌因素作用
激素水平影响：内分泌紊乱可能与畸胎瘤的发生相关。例如，雌激素水平的异常变化可能会影响生殖细胞的分化状态。在女性体内，雌激素对卵巢的生理功能有重要调节作用，当雌激素水平出现异常波动时，可能干扰卵巢内生殖细胞的正常分化过程，增加卵巢畸胎瘤的发生风险。而男性体内雄激素等激素水平的异常，也可能影响睾丸内生殖细胞的正常状态，从而与睾丸畸胎瘤的发生存在关联。不同年龄阶段的人群内分泌状态不同，青春期、育龄期、围绝经期等不同阶段的激素水平变化差异较大，这也会影响畸胎瘤在不同年龄人群中的发生概率。比如青春期女性内分泌处于活跃变化阶段，相对来说可能在这个时期卵巢畸胎瘤的发病风险会有一定特点；育龄期女性激素水平相对稳定，但也可能因个体差异出现激素波动而引发畸胎瘤。
四、环境因素干扰
环境污染影响：长期暴露于某些环境污染物质中可能增加畸胎瘤的发生风险。例如，一些化学污染物，如多环芳烃、有机氯农药等，可能会干扰人体的内分泌系统和细胞的遗传物质，影响生殖细胞的正常分化和发育。生活在污染较为严重地区的人群，接触这些环境污染物的机会较多，相对而言发生畸胎瘤的可能性可能会有所升高。不同生活方式的人群接触环境污染物的程度不同，比如长期从事化工行业相关工作的人群，由于职业暴露，接触污染物质的概率更高，其患畸胎瘤的风险可能较一般人群有所增加；而长期处于良好生态环境地区、生活方式健康的人群，接触污染物质较少，发生畸胎瘤的风险相对较低。
五、免疫因素异常
免疫功能失调：机体免疫功能异常时，可能无法正常识别和清除异常分化的生殖细胞，从而导致畸胎瘤的形成。例如，当免疫系统的监视功能出现缺陷时，异常增殖分化的生殖细胞不能被及时清除，就会逐渐发展成畸胎瘤。不同健康状况的人群免疫功能不同，本身患有自身免疫性疾病的人群，其免疫功能处于失调状态，发生畸胎瘤的风险可能会高于健康人群。比如患有系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病的患者，由于免疫功能紊乱，对异常细胞的监视和清除能力下降，更容易出现生殖细胞的异常分化，进而引发畸胎瘤。在儿童群体中，免疫系统还在发育完善过程中，相对成人来说免疫功能更易出现不稳定情况，所以儿童患畸胎瘤时，免疫因素的影响可能与成人有所不同，需要特别关注儿童免疫系统发育对畸胎瘤发生的影响及相应的应对措施。
