室间隔和房间隔缺损的严重程度需综合缺损大小、年龄、性别、生活方式、病史等多方面因素判断。缺损大小是关键，小型影响相对小，中型有一定影响，大型影响大且易引发严重并发症；新生儿和婴儿期较小缺损也可能有明显影响，年龄越大缺损越大、存在越久损害越重；性别不是关键因素；不良生活方式会加重病情；反复呼吸道感染史会加重负担，有家族史的大型缺损病情进展可能更快。
缺损大小影响：
小型室间隔缺损：直径小于0.5cm，对心脏功能影响相对较小，部分患儿可能在儿童期甚至成年后都无明显症状，生长发育也可接近正常人群。这是因为缺损小，左向右分流量少，对肺循环和体循环的血流动力学影响较轻，依据是相关研究表明小型室间隔缺损患儿远期发生严重并发症的风险较低。
中型室间隔缺损：直径在0.5-1.0cm之间，可能会引起一定程度的血流动力学改变，随着年龄增长，可能会出现活动后气促、乏力等表现，对生长发育有一定影响，因为中等量的左向右分流会使肺循环血量增加，长期可导致肺血管病变等潜在风险。
大型室间隔缺损：直径大于1.0cm，出生后即可出现明显症状，如喂养困难、生长发育迟缓、反复呼吸道感染等。由于大量左向右分流，肺循环血量显著增加，肺动脉压力逐渐升高，若不及时治疗，可能在儿童期就发展为肺动脉高压、艾森曼格综合征等严重并发症，艾森曼格综合征会导致右向左分流，出现发绀等严重表现，严重影响患儿的生活质量和寿命，相关临床资料显示大型室间隔缺损未经治疗的患儿预后较差。
房间隔缺损
缺损大小影响：
小型房间隔缺损：直径小于5mm，很多患儿可能终身无症状，不影响正常的生长发育和生活，因为分流量小，对心肺功能的影响微乎其微，相关随访研究发现小型房间隔缺损患儿成年后发生心脏相关并发症的概率与正常人群无显著差异。
中型房间隔缺损：直径在5-10mm之间，部分患儿可能在青少年期或成年早期出现活动后心悸、气促等症状，对心脏功能有一定影响，会使右心负荷逐渐增加，长期可能导致右心扩大等情况，但相对大型缺损来说进展较为缓慢。
大型房间隔缺损：直径大于10mm，症状出现较早，婴儿期可能就表现为呼吸急促、多汗、喂养困难等，随着年龄增长，可出现肺动脉高压、心房纤颤等并发症，严重时会影响心脏功能和全身血液循环，大型房间隔缺损患儿若不及时干预，预后不良，可能会出现严重的心功能不全等问题。
年龄因素影响
对于新生儿和婴儿时期的缺损患儿，由于心肺功能发育尚不完善，较小的缺损也可能对其产生较明显的影响，如影响生长发育、增加感染风险等。而对于年龄较大的儿童或成年人，缺损对身体的影响程度会因个体差异以及缺损大小等因素有所不同，但总体来说，缺损越大、存在时间越久，对心脏功能的损害通常越严重。
例如，新生儿小型室间隔缺损相对婴儿期较大缺损来说，可能症状不典型，但随着月龄增加，若缺损未自行闭合，仍可能逐渐出现影响生长发育等情况；成年人小型房间隔缺损可能在体检时偶然发现，若不及时关注，随着年龄增长，也可能出现心功能逐渐下降等问题。
性别因素影响
一般来说，性别本身不是直接决定室间隔和房间隔缺损严重程度的关键因素，但在疾病的发展过程中，可能因个体差异存在不同表现。例如，在一些研究中发现，不同性别患儿对缺损导致的血流动力学改变的适应能力可能略有不同，但这并非是决定严重程度的主导因素，关键还是在于缺损的大小、存在时间等因素。
比如，同样大小的室间隔缺损，在男性和女性患儿中的表现可能在早期差异不明显，但随着病情进展，可能因个体对心脏代偿机制的不同而有一定差异，但这种差异相对缺损大小等因素来说影响较小。
生活方式影响
对于患有室间隔或房间隔缺损的患儿，不良的生活方式会加重病情的发展。例如，过度劳累会增加心脏负担，对于缺损患儿来说，本就存在心脏血流动力学异常，过度劳累可能导致心悸、气促等症状加重。而合理的生活方式，如适当的运动（在病情允许范围内）有助于增强心肺功能，但运动要适度，避免剧烈运动。
成年人患者若有不良生活方式，如长期熬夜、吸烟、酗酒等，会加速心脏病变的进展，使原本不严重的缺损相关病情恶化，因为这些不良生活方式会影响心血管系统的正常功能，加重心脏的负担和损害。
病史相关影响
若患儿有反复呼吸道感染的病史，对于室间隔和房间隔缺损患儿来说，会进一步加重心脏的负担，因为感染会使心率加快、心输出量增加等，对于已经存在缺损的心脏，这种额外的负担可能导致病情进展加快。而有先天性心脏病家族史的患儿，其室间隔或房间隔缺损的发生可能与遗传因素有关，这类患儿的病情严重程度可能在一定程度上受遗传背景影响，但最终还是以缺损本身的特征为主。例如，有家族史的患儿若存在大型室间隔缺损，其病情往往进展相对更快，需要更积极的治疗干预。
