直肠炎的病因包括感染因素和非感染因素。感染因素有细菌（痢疾杆菌、大肠杆菌）、病毒（轮状病毒、腺病毒）、寄生虫（溶组织内阿米巴原虫、血吸虫）感染；非感染因素包括理化因素刺激（长期腹泻、长期便秘、放射性损伤、化学药物刺激）、免疫因素（炎症性肠病、自身免疫性疾病累及直肠）以及遗传、环境等其他因素。
痢疾杆菌：志贺菌属的痢疾杆菌可引发直肠炎症。例如，志贺菌侵袭直肠黏膜，导致黏膜充血、水肿、糜烂等炎症改变。在卫生条件较差、饮用水被污染的地区，人群感染痢疾杆菌的风险较高，儿童由于卫生习惯相对较差且免疫系统发育尚未完善，更容易受到影响。
大肠杆菌：某些血清型的大肠杆菌可引起直肠感染性炎症。当人体抵抗力下降时，肠道内的大肠杆菌可能过度繁殖并侵袭直肠黏膜。长期使用广谱抗生素的人群，肠道菌群失调，大肠杆菌等条件致病菌容易滋生，增加直肠炎发生风险。
病毒感染：
轮状病毒：主要感染婴幼儿，可引起腹泻，进而导致直肠炎症。轮状病毒通过侵犯肠道黏膜，尤其是直肠和结肠黏膜，引起黏膜的炎症反应。在托幼机构等儿童密集场所，轮状病毒容易传播，造成婴幼儿直肠炎的聚集性发生。
腺病毒：腺病毒感染也可能累及直肠，引发直肠炎症。腺病毒感染可引起呼吸道、胃肠道等多系统症状，对于儿童来说，腺病毒导致的胃肠道感染中直肠炎并不少见，其传播途径主要是通过飞沫传播和接触被污染的物体表面。
寄生虫感染：
溶组织内阿米巴原虫：阿米巴滋养体可侵犯直肠黏膜，引起直肠炎。在卫生条件落后、水源被污染的地区较为常见。人体摄入被阿米巴原虫污染的食物或水后，滋养体侵入直肠黏膜，导致黏膜溃疡、出血等炎症表现，慢性感染可使直肠黏膜出现增生等改变。
血吸虫：血吸虫寄生在人体门静脉系统，其虫卵可沉积在直肠黏膜下，引起免疫反应和炎症。在血吸虫病流行区，人群接触含有血吸虫尾蚴的疫水后，尾蚴侵入人体并发育为成虫，虫卵沉积在直肠等部位，引发直肠炎，长期感染可能导致直肠黏膜的纤维化等病变。
非感染因素
理化因素刺激：
长期腹泻：频繁的腹泻使肠道内容物，尤其是一些刺激性物质频繁刺激直肠黏膜。例如，炎症性肠病患者常伴有长期腹泻，肠道内的炎性介质、未消化的食物残渣等不断刺激直肠，导致直肠黏膜反复受损，引发直肠炎。儿童长期腹泻可能与食物过敏、乳糖不耐受等有关，如牛奶蛋白过敏的儿童，食用含牛奶的食物后出现腹泻，长期刺激直肠可致直肠炎。
长期便秘：干结的粪便在直肠内停留时间过长，对直肠黏膜产生机械性损伤，同时粪便中的有害物质持续刺激直肠黏膜，容易引发直肠炎。老年人由于胃肠蠕动功能减弱，容易出现便秘，是直肠炎的高发人群之一；儿童若饮食中膳食纤维摄入不足、饮水少等也可能导致便秘，增加直肠炎风险。
放射性损伤：盆腔部位恶性肿瘤进行放射治疗时，直肠容易受到射线的照射而发生炎症。例如，宫颈癌、前列腺癌等患者在放疗过程中，直肠黏膜受到辐射损伤，出现充血、水肿、溃疡等炎症改变。放疗引起的直肠炎可能在放疗期间就出现，也可能在放疗结束后一段时间才逐渐显现，且恢复较为缓慢。
化学药物刺激：长期服用某些刺激性药物，如非甾体类抗炎药（如阿司匹林），药物可直接刺激直肠黏膜，导致直肠炎症。一些化疗药物在使用过程中也可能对直肠黏膜造成损伤，引起直肠炎。对于有基础疾病需要长期服药的人群，如老年人患有心血管疾病需长期服用阿司匹林等药物时，要密切关注直肠黏膜情况，儿童一般较少使用此类可能导致直肠炎的药物，但如果有特殊情况使用时也需谨慎评估风险。
免疫因素：
炎症性肠病：如溃疡性结肠炎，其病因与免疫因素密切相关。患者自身免疫系统异常，攻击直肠和结肠黏膜，导致慢性炎症持续存在。免疫系统错误地将肠道黏膜当作外来异物进行攻击，引发肠道黏膜的炎症反应，表现为直肠黏膜的充血、糜烂、溃疡等改变，病情容易反复发作，病程较长。儿童患溃疡性结肠炎相对较少，但也有报道，其发病可能与遗传易感性和环境因素共同作用有关，免疫紊乱是关键因素之一。
自身免疫性疾病累及直肠：如类风湿关节炎等自身免疫性疾病，虽然主要累及关节，但也可能出现肠道黏膜的免疫损伤，导致直肠炎。自身抗体攻击肠道黏膜组织，引起炎症反应，其发病机制涉及复杂的免疫调节异常，患者除了关节症状外，可能出现腹痛、腹泻、直肠出血等直肠炎相关表现。
其他因素：
遗传因素：某些直肠炎的发生与遗传有关。例如，溃疡性结肠炎具有一定的遗传易感性，家族中有溃疡性结肠炎患者的人群，其发病风险相对较高。遗传因素可能通过影响免疫系统的发育和调节等方面，使个体更容易发生肠道免疫紊乱相关的直肠炎症。
环境因素：长期处于精神紧张、压力大的状态可能影响肠道的免疫功能和胃肠蠕动等，增加直肠炎的发生风险。此外，空气污染、化学物质暴露等环境因素也可能对直肠黏膜产生不良影响，虽然具体机制尚不完全明确，但环境因素与直肠炎的发生存在一定关联。
