滤泡性结膜炎的治疗包括一般治疗、药物治疗、中药治疗等。
1、一般治疗
对于有滤泡性结膜炎的患者，需尽量避免接触可能的过敏原，如花粉、尘螨等。在花粉传播季节，应减少外出，或在外出时佩戴口罩。对于有空气污染的环境，也应尽量避免长时间暴露，例如在雾霾天气时减少户外活动。保持眼部清洁，使用干净的毛巾或纸巾轻轻擦拭眼部。
2、药物治疗
如氟米龙滴眼液等，具有抗炎作用，可减轻眼部的炎症反应，缓解滤泡性结膜炎引起的眼部红肿、疼痛等症状。但糖皮质激素的使用需要谨慎，长期或不当使用可能会引起眼压升高、白内障等不良反应。如果滤泡性结膜炎是由过敏因素引起，可使用抗组胺类药物，如富马酸依美斯汀滴眼液等。这类药物能拮抗组胺受体，减轻过敏导致的眼部症状，如眼痒等。
3、中药治疗
一些中医的中药熏洗方法在一定程度上可能对缓解滤泡性结膜炎的症状有辅助作用，但需要在专业中医医师的指导下进行。例如使用一些具有清热解毒、祛风止痒作用的中药进行熏洗眼部，但要注意中药的温度和浓度，避免烫伤眼部。
对于不同体质的患者，中医的辩证施治有所不同，如体质偏热的患者可能更适合清热解毒的中药熏洗，而体质偏寒的患者则需要谨慎使用这类方法。
