习惯性流产受遗传、解剖、内分泌、免疫、感染、生活方式及环境等多种因素影响。遗传因素有染色体异常；解剖因素包括子宫畸形、宫腔粘连；内分泌因素涉及黄体功能不全、甲状腺功能异常；免疫因素有自身免疫异常、同种免疫异常；感染因素是生殖道感染；生活方式因素如长期吸烟酗酒、过度劳累等；环境因素为长期接触化学物质或高辐射环境等均可导致习惯性流产。
解剖因素
子宫解剖结构异常
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等。子宫畸形会使子宫腔形态异常，影响胚胎的着床和发育。以纵隔子宫为例，纵隔将子宫腔分成两部分，宫腔容积相对减小，内膜血供可能不足，不利于胚胎的生长，从而增加流产风险。这类情况在青春期女性中可能因子宫发育尚未完全定型而被忽视，在育龄期女性中则会因反复流产而被发现。
宫腔粘连：多因人工流产、刮宫等宫腔操作损伤子宫内膜，导致宫腔部分或全部粘连。宫腔粘连会使宫腔有效面积减少，影响胚胎种植及发育所需的微环境，进而引发习惯性流产。有过多次宫腔操作史的女性发生宫腔粘连的风险较高，尤其是年龄较轻但频繁进行宫腔操作的女性，子宫内膜修复能力相对较弱，更易出现宫腔粘连问题。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕酮分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境。研究表明，约30%-40%的习惯性流产与黄体功能不全有关。女性自身内分泌调节机制异常、垂体-卵巢轴功能紊乱等都可能导致黄体功能不全，这种情况在有甲状腺疾病、高泌乳素血症等内分泌疾病的女性中更易发生，且年龄增长可能会加重内分泌失调的情况，影响黄体功能。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进均可能引起习惯性流产。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响母体的新陈代谢及胚胎的生长发育，导致流产风险增加；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平会干扰妊娠的正常进程。患有甲状腺疾病的女性在计划怀孕前需将甲状腺功能调整至正常范围，否则即使成功怀孕，也易出现习惯性流产，这类女性在孕期需要密切监测甲状腺功能指标，因为孕期甲状腺功能的波动也可能对妊娠产生不良影响。
免疫因素
自身免疫异常：体内存在抗磷脂抗体、抗核抗体等自身抗体时，会影响胎盘的血管形成和血液供应，导致胎盘缺血、缺氧，从而引发流产。抗磷脂抗体综合征患者中约50%-60%会出现习惯性流产，这类自身免疫性疾病的发生与遗传、感染等多种因素有关，女性一旦患有此类疾病，在妊娠过程中需要进行特殊的免疫监测和干预。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受不足，将胚胎视为“异物”进行攻击，导致流产。正常妊娠时，母体免疫系统对胚胎产生免疫耐受，使得胚胎能够在母体内存活。当这种免疫耐受机制出现异常时，就会发生同种免疫性流产。例如，自然杀伤细胞活性过高时，会对胚胎造成损伤，这类情况在反复流产的女性中较为常见，且可能与个体的免疫遗传背景有关。
感染因素
生殖道感染：细菌、病毒等病原体感染生殖道后，可通过胎盘感染胎儿，影响胚胎发育。例如，支原体、衣原体感染可引起绒毛膜羊膜炎，导致胎膜早破、流产；风疹病毒、巨细胞病毒等感染可造成胎儿畸形、发育停滞，从而引发流产。女性在孕期若发生生殖道感染，尤其是在孕早期，感染对胚胎的影响更大。有不洁性生活史、频繁更换性伴侣等高危行为的女性，感染生殖道病原体的风险增加，从而增加习惯性流产的发生概率。
其他因素
生活方式因素：长期吸烟、酗酒的女性发生习惯性流产的风险高于正常女性。烟草中的尼古丁等有害物质会影响胎盘血管的收缩和舒张，减少胎盘血流；酒精会干扰胚胎的正常发育。此外，过度劳累、精神压力过大等也可能通过影响内分泌、免疫等系统，增加习惯性流产的发生风险。年轻女性若长期熬夜、生活不规律，也可能对自身的生殖内分泌环境产生不良影响，进而影响妊娠结局。
环境因素：长期接触某些化学物质，如铅、汞、苯等，或处于高辐射环境中，会增加习惯性流产的发生几率。这些有害物质可能通过影响胚胎细胞的分裂、分化等过程，导致胚胎发育异常。在一些职业环境中，如从事化工、放射等工作的人群，需要特别注意防护，以降低环境因素对妊娠的不良影响。
