阴道毛滴虫病难以治愈与病原体生物学特性、宿主因素及治疗相关因素有关。病原体滋养体具多变性、增殖快，还可能形成包囊；宿主方面女性生理结构易致环境改变、免疫力下降，性行为易致相互感染；治疗上存在药物使用不合理、疗程不足及患者治疗依从性差等问题。
一、病原体的生物学特性相关因素
1.滋养体的多变性
阴道毛滴虫以滋养体形式存在，其具有较强的适应能力。在不同的阴道环境中，滋养体可以通过改变自身的代谢方式来应对不利环境。例如，当阴道内酸碱度等环境因素发生变化时，滋养体能够调整自身的细胞膜结构和酶系统，以维持生存。研究表明，阴道毛滴虫的滋养体能够在一定范围内耐受阴道内pH值的波动，这使得它不容易被完全清除。
滋养体具有快速增殖的特点，在适宜的阴道环境中，它可以在短时间内大量繁殖，一旦治疗不彻底，残留的滋养体很快就会再次大量繁殖，导致疾病复发。
2.包囊形成的潜在可能
虽然阴道毛滴虫主要以滋养体形式存在，但在某些特殊情况下可能会形成包囊。包囊具有较强的抵抗力，能够在外界环境中存活较长时间。如果在治疗过程中没有将可能形成的包囊完全杀灭，当条件适宜时，包囊又可以转化为滋养体，从而再次引发阴道毛滴虫病。不过，阴道毛滴虫形成包囊的具体条件和机制还在进一步研究中，但这一特性确实增加了疾病难以治愈的可能性。
二、宿主方面的因素
1.女性生理结构因素
女性阴道与尿道、肛门相邻，局部环境较为潮湿且容易受到污染。阴道的pH值在正常情况下维持在3.8-4.4之间，这种酸性环境对阴道毛滴虫的生长有一定抑制作用，但当局部环境改变时，如经期、孕期等特殊时期，阴道pH值可能会发生变化，有利于阴道毛滴虫的生长繁殖。例如，孕期女性由于体内激素水平的变化，阴道上皮细胞糖原含量增加，阴道pH值升高，更适合阴道毛滴虫生长，这使得孕期阴道毛滴虫病的治疗相对困难，且复发率较高。
阴道的自净作用在正常情况下可以抑制多种病原体的生长，但当宿主的免疫力下降时，自净作用减弱。例如，长期使用抗生素、患有糖尿病等疾病的女性，其阴道局部免疫力降低，容易感染阴道毛滴虫且难以治愈。糖尿病患者由于血糖升高，阴道内糖原含量增加，pH值改变，为阴道毛滴虫提供了良好的生长环境，同时高血糖状态也不利于机体的免疫功能，使得阴道毛滴虫病的治疗效果不佳，容易复发。
2.性行为因素
阴道毛滴虫病主要通过性行为传播，性伴侣之间容易相互感染。如果一方感染了阴道毛滴虫，在没有同时治疗性伴侣的情况下，即使患者自身经过治疗症状消失，但与性伴侣发生性行为时又会再次感染，导致疾病难以治愈。据相关研究显示，约有一半的女性患者的性伴侣也会携带阴道毛滴虫，若不进行同时治疗，复发率可高达90%以上。
三、治疗相关因素
1.药物使用不合理
药物选择不当：不同的抗阴道毛滴虫药物对阴道毛滴虫的作用机制不同，但如果没有根据患者的具体情况合理选择药物，可能无法有效杀灭阴道毛滴虫。例如，对于合并其他阴道感染的患者，如果只使用单一的抗阴道毛滴虫药物，而没有针对合并感染进行相应治疗，就容易导致阴道毛滴虫病难以治愈。
用药疗程不足：阴道毛滴虫病的治疗需要足够的疗程来确保彻底杀灭病原体。如果患者在症状缓解后就自行停药，往往会导致残留的滋养体继续繁殖，从而使疾病复发。一般来说，正规的治疗疗程需要持续7-10天甚至更长时间，但很多患者不能严格遵守疗程，这是导致疾病难以治愈的重要原因之一。
2.治疗依从性问题
患者方面：部分患者对阴道毛滴虫病的重视程度不够，没有按照医生的要求进行规范治疗。例如，有些患者在用药过程中不能按时用药，或者在症状消失后就停止用药，这些行为都不利于疾病的彻底治愈。另外，一些患者可能因为对治疗过程中的不适等情况不能正确对待，而中断治疗，从而影响治疗效果。
医疗服务方面：在医疗服务过程中，如果医生与患者的沟通不够充分，患者没有完全理解治疗的要求和注意事项，也会影响治疗依从性。例如，医生没有详细向患者解释用药的重要性、疗程要求以及性伴侣同时治疗的必要性等，导致患者在治疗过程中出现不依从的情况，进而使阴道毛滴虫病难以治愈。
