少精症的发生与多种因素相关，包括遗传因素（染色体异常影响精子生成发育）、内分泌因素（下丘脑-垂体-性腺轴功能紊乱、甲状腺功能异常影响生殖内分泌）、感染因素（生殖道感染改变精浆成分影响精子）、免疫因素（自身免疫性睾丸炎产生抗体干扰精子生成）、精索静脉曲张（血液回流障碍致睾丸缺氧毒性积聚影响精子）、环境因素（长期接触高温、放射性物质、化学毒物抑制精子生成）、生活方式因素（长期吸烟酗酒、过度劳累熬夜干扰内分泌影响精子）以及其他因素（糖尿病、慢性肾功能衰竭等全身性疾病影响生殖系统致少精症）。
内分泌因素
下丘脑-垂体-性腺轴功能紊乱：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）减少，会导致垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）降低，进而影响睾丸的生精功能。例如，垂体瘤患者可能出现促性腺激素分泌异常，从而引起少精症。男性和女性在这一轴系中都可能存在问题，男性垂体病变等可直接影响该轴系功能，女性若内分泌失调影响到GnRH的分泌等，也可能通过内分泌网络间接影响男性生殖相关的激素水平，导致少精症。
甲状腺功能异常：甲状腺功能亢进或减退均可影响生殖内分泌功能。甲状腺功能亢进时，过多的甲状腺激素可抑制下丘脑-垂体-性腺轴，导致精子生成减少；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，也会影响生殖激素的正常分泌，从而引起少精症。不同年龄的患者都可能受到甲状腺功能异常的影响，年龄较小的患者若甲状腺功能出现问题，会影响其生长发育过程中的生殖系统发育；成年患者则会直接影响精子的生成数量等情况。
感染因素
生殖道感染：附睾炎、前列腺炎、精囊炎等生殖道感染性疾病可影响精子的生成和存活。例如，大肠杆菌等细菌感染引起的前列腺炎，会改变精浆的成分，影响精子的活力和数量。各种年龄段的人群都可能发生生殖道感染，儿童时期若发生特定的生殖道感染性疾病，若未及时治疗可能影响成年后的生殖功能；成年男性若不注意个人卫生等，容易发生生殖道感染，进而导致少精症。
免疫因素
自身免疫性睾丸炎：自身免疫系统产生的抗体攻击睾丸组织，影响生精功能。例如，男性体内存在抗精子抗体，可与精子结合，阻碍精子的正常运动和受精能力，同时也会干扰精子的生成过程，导致少精症。不同性别中男性更容易发生自身免疫性睾丸炎相关的免疫问题，因为男性生殖系统的特殊结构等因素使其自身免疫反应更易针对睾丸组织，当然女性若存在自身免疫相关的生殖系统异常，也可能通过间接方式影响男性生殖情况。
精索静脉曲张
血液回流障碍：精索静脉曲张时，阴囊内温度升高，静脉血淤积，导致睾丸局部缺氧，毒性物质积聚，影响精子的生成和发育。一般来说，左侧精索静脉曲张更为常见，这与精索静脉的解剖特点有关。青少年及成年男性都可能发生精索静脉曲张，青少年时期若存在精索静脉曲张，会影响睾丸的正常发育，导致成年后少精症的发生风险增加；成年男性精索静脉曲张若未得到及时处理，也会逐渐影响精子的生成数量。
环境因素
理化因素：长期接触高温环境，如长时间泡热水澡、蒸桑拿等，会使睾丸温度升高，影响精子生成；长期接触放射性物质，如X射线、γ射线等，可损害生精细胞；长期接触某些化学毒物，如农药、重金属（铅、汞等）、有机溶剂（苯、甲醛等），也会抑制精子的生成。不同生活方式的人群接触这些理化因素的概率不同，长期从事高温作业的工人、经常接触放射性物质的工作人员、长期处于化学毒物环境中的人员等发生少精症的风险相对较高。不同年龄的人群中，青壮年男性若有上述接触情况，受影响更为明显，儿童若接触这些理化因素也可能对未来的生殖系统发育产生不良影响。
生活方式因素
不良生活习惯：长期大量吸烟、酗酒可影响精子的质量和数量。吸烟中的尼古丁等有害物质可降低精子的活力，减少精子数量；酗酒会导致性腺中毒，损害生精细胞，影响精子的生成。过度劳累、长期熬夜等也会干扰内分泌功能，进而影响精子的生成。不同性别中男性的这些不良生活方式更为常见，男性长期吸烟酗酒等会直接影响自身的生殖系统功能，导致少精症等问题；女性若有类似不良生活方式，也可能通过共同生活环境等间接影响男性生殖情况。不同年龄阶段的男性，青壮年时期若有这些不良生活方式，对生殖系统的损害更为显著。
其他因素
全身性疾病：一些全身性疾病，如糖尿病、慢性肾功能衰竭等也可能引起少精症。糖尿病患者由于糖代谢紊乱，可影响生殖系统的微血管和神经，导致生精功能障碍；慢性肾功能衰竭患者体内毒素积聚，会干扰内分泌和代谢功能，进而影响精子的生成。不同年龄、不同性别的患者若患有这些全身性疾病，都可能因为疾病本身的病理生理过程影响到生殖系统，导致少精症的发生。例如，老年糖尿病患者可能因为长期高血糖等情况逐渐出现少精症表现，儿童期患有慢性肾功能衰竭也可能对未来的生殖功能发育造成不良影响。
