阴茎短小的原因为激素分泌异常、染色体异常、外伤或手术影响、内分泌疾病影响。
1.激素分泌异常
在胚胎发育时期，如果体内雄激素分泌不足，会影响阴茎的正常发育。例如，先天性睾丸发育不全综合征患者，由于睾丸功能异常，雄激素分泌减少，可能导致阴茎短小。这种情况与遗传因素以及胚胎早期的发育过程密切相关，属于先天性的内分泌紊乱导致的阴茎发育异常。
2.染色体异常
某些染色体异常疾病也会影响阴茎发育，如克氏综合征，患者染色体核型为47，XXY，除了有阴茎短小的表现外，还常伴有睾丸发育不良等情况。这是由于染色体异常导致了基因表达的异常，进而影响了生殖系统的正常发育过程。
3.外伤或手术影响
如果阴茎受到严重外伤，如骨盆骨折等导致阴茎海绵体损伤，或者因某些疾病进行阴茎相关手术时操作不当，可能会影响阴茎的正常发育和勃起功能，导致阴茎短小。例如，在进行尿道下裂修复手术时，如果手术操作失误，可能会影响阴茎海绵体的发育，从而出现阴茎短小的情况。
4.内分泌疾病影响
一些后天获得的内分泌疾病也可能导致阴茎短小。例如，垂体瘤患者可能会出现垂体功能减退，导致促性腺激素分泌减少，进而影响睾丸雄激素的分泌，影响阴茎发育。这种情况与患者的生活方式关系相对较小，但与自身内分泌系统的疾病状态密切相关。
