多囊卵巢综合症与卵巢囊肿是不同疾病，在疾病定义与本质上，前者是生殖内分泌代谢性疾病，本质是内分泌紊乱及代谢异常，后者是卵巢内或表面的囊状结构，有生理性和病理性；发病机制上，前者与遗传等致下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能失衡等有关，后者生理性由月经周期因素致，病理性与多种因素相关；临床表现上，前者有月经失调等多种表现，后者较小囊肿多无症状，较大或特殊类型有相应症状；诊断方法上，前者依据特定临床表现、激素测定及超声等并符合Rotterdam诊断标准，后者靠妇科检查结合超声等及肿瘤标志物检测；治疗原则上，前者依需求促排卵等，后者生理性可随访，病理性大等多需手术等。
一、疾病定义与本质
多囊卵巢综合症（PCOS）：是一种常见的生殖内分泌代谢性疾病，本质是内分泌紊乱及代谢异常。主要特征为卵巢呈多囊样改变、雄激素水平升高、排卵障碍等，多发生于育龄女性，与遗传、环境等多种因素相关，可影响生育、代谢等多方面功能。
卵巢囊肿：是卵巢内或其表面形成的囊状结构，可为生理性或病理性。生理性囊肿如卵泡囊肿、黄体囊肿等，多与月经周期有关；病理性囊肿则有上皮性囊肿、巧克力囊肿等多种类型，可由炎症、内分泌失调、遗传等因素引起，各年龄段女性均可发病。
二、发病机制差异
多囊卵巢综合症：遗传因素可能使个体易患PCOS，如某些基因变异可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的调节功能，导致促性腺激素分泌失衡，雄激素分泌增多，进而出现排卵障碍和卵巢多囊样改变，同时常伴有胰岛素抵抗，影响糖脂代谢。
卵巢囊肿：生理性卵巢囊肿是由于卵泡发育异常或黄体萎缩不全等月经周期相关因素导致；病理性卵巢囊肿中，上皮性囊肿可能与卵巢表面上皮的异常增生有关，巧克力囊肿是子宫内膜异位至卵巢，反复出血形成囊肿，炎症性囊肿则与盆腔炎症累及卵巢导致渗出、包裹形成囊肿相关。
三、临床表现区别
多囊卵巢综合症：常见临床表现有月经失调，如月经稀发、闭经或不规则子宫出血；多毛、痤疮等高雄激素表现；肥胖；不孕，因排卵障碍影响受孕；部分患者还可出现黑棘皮症等。
卵巢囊肿：较小的卵巢囊肿多无明显症状，常在妇科检查或超声检查时发现；囊肿较大时可出现下腹坠胀、疼痛，若发生扭转或破裂可引起急性剧烈腹痛；一些特殊类型的卵巢囊肿如巧克力囊肿可导致痛经进行性加重、不孕等，生理性囊肿可能在月经周期特定阶段出现相关症状，随周期变化可能自行消失或增大。
四、诊断方法不同
多囊卵巢综合症：主要依据临床表现、激素测定（如血清雄激素升高、LH/FSH比值异常等）及超声检查（卵巢多囊样改变：单侧或双侧卵巢直径2-9mm的卵泡≥12个，和/或卵巢体积≥10ml）来诊断，需符合Rotterdam诊断标准中的3项：稀发排卵或无排卵；临床和/或生化表现为高雄激素血症；卵巢多囊样改变，同时排除其他类似疾病。
卵巢囊肿：主要通过妇科检查触及附件区肿块，结合超声检查明确囊肿的部位、大小、形态、性质（囊性、实性等），必要时可结合CT、磁共振成像（MRI）等检查进一步鉴别囊肿性质，对于肿瘤标志物如CA125、CA199等的检测有助于判断囊肿是否为恶性。
五、治疗原则有别
多囊卵巢综合症：治疗需根据患者的具体需求而定，对于有生育需求的患者，主要是促排卵治疗以帮助怀孕；对于调整月经周期、改善高雄激素症状，可使用口服避孕药等药物；对于肥胖患者，生活方式调整（包括饮食控制、增加运动）是基础治疗，可改善胰岛素抵抗等代谢异常情况。
卵巢囊肿：生理性囊肿多可随访观察，部分可自行消退；对于病理性囊肿，若囊肿较大（直径≥5cm）、怀疑为恶性或有症状的囊肿多需手术治疗，手术方式包括卵巢囊肿剥除术、患侧卵巢切除术等；对于一些特殊类型的卵巢囊肿如巧克力囊肿，治疗上除手术外，还可能需要配合药物抑制内膜异位复发等治疗。
总之，多囊卵巢综合症和卵巢囊肿在疾病定义、发病机制、临床表现、诊断及治疗等方面均有明显不同，并非同一种疾病。
