第一胎自然流产的原因包括染色体异常（夫妻双方染色体数目或结构异常、女性年龄大卵子质量及男性年龄大精子染色体易异常）、母体因素（内分泌异常如黄体功能不全、甲状腺功能异常；生殖器官异常如子宫畸形、宫腔粘连；免疫因素如自身免疫性疾病、同种免疫异常；全身性疾病如感染、严重贫血）、父亲因素（精子质量问题）、生活方式因素（吸烟饮酒、接触有害物质）。
年龄因素影响：女性年龄越大，卵子质量下降，染色体发生异常的概率增加。一般来说，35岁以上的女性染色体异常的风险明显升高，这也是该年龄段女性自然流产率相对较高的原因之一；男性随着年龄增长，精子的染色体也可能出现异常情况。
母体因素
内分泌异常
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，就不能为胚胎着床和发育提供良好的子宫内环境，从而增加自然流产的风险。研究表明，约30%-40%的自然流产与黄体功能不全有关。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都会影响妊娠。甲状腺功能减退时，机体内分泌紊乱，会干扰胚胎的发育进程；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会对胎儿的生长发育产生不利影响，增加自然流产的可能性。
生殖器官异常
子宫畸形：如子宫纵隔、单角子宫等子宫畸形情况，会影响子宫的宫腔形态和容积，使胚胎着床后空间不足，不利于胚胎的生长发育，容易引发自然流产。例如，子宫纵隔会分割宫腔，导致胚胎种植面积减少，影响营养供应等。
宫腔粘连：宫腔粘连会使宫腔有效容积减小，影响胚胎的着床和发育，增加自然流产的风险。宫腔粘连可能是由于刮宫等宫腔操作损伤子宫内膜后引起的。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胚胎，导致胚胎发育受损，引发自然流产。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受不足，母体免疫系统将胚胎视为外来异物进行攻击，从而导致自然流产。例如，母胎免疫调节失衡，Th1/Th2细胞因子平衡失调等情况都可能属于同种免疫异常范畴。
全身性疾病
感染：孕期感染某些病原体，如弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等，病原体可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎发育，引发自然流产。例如，孕妇感染风疹病毒后，约10%-20%的胎儿会出现严重的先天性缺陷，并且容易发生自然流产。
严重贫血：孕妇严重贫血时，身体各器官包括胎盘的供氧不足，影响胚胎的营养供应和正常发育，增加自然流产的风险。
父亲因素
精子质量问题：父亲的精子染色体异常、精子畸形率过高或精子活力低下等都会影响受精及胚胎发育。例如，精子染色体异常可导致胚胎染色体异常，从而引发自然流产；精子畸形率过高时，畸形的精子参与受精后形成的胚胎质量往往较差，容易发生自然流产。
生活方式因素
吸烟饮酒：孕妇吸烟或被动吸烟，烟草中的尼古丁等有害物质会影响胎盘的血液循环，导致胎儿缺氧，影响胚胎发育；男性吸烟饮酒也会影响精子质量，进而影响胚胎的正常形成。有研究表明，孕妇每天吸烟10支以上，自然流产的风险会明显增加；男性长期大量饮酒会使精子质量下降，增加自然流产的可能性。
接触有害物质：孕妇长期接触放射性物质、化学毒物等，如苯、甲醛等，这些有害物质可能通过胎盘影响胚胎发育，引发自然流产。例如，在职业环境中接触此类有害物质的孕妇，自然流产的风险高于一般人群。
