三叉神经痛的发病与多种因素相关，责任血管方面约90%由小脑上动脉等压迫致神经髓鞘变性、冲动传导短路，年龄增长、高血压等生活方式会增加压迫几率；神经结构异常中脱髓鞘改变致冲动异常传导，既往感染病史、女性特殊生理时期易引发；遗传因素有一定易感性，家族性患者发病年龄可能较早；肿瘤因素如颅底等肿瘤压迫可致痛，有相关病史或家族史者风险高，不同性别无明显特异性差异。
三叉神经痛中约90%是由于三叉神经根部受到小脑上动脉、小脑前下动脉等血管的压迫所致。这些血管长期压迫三叉神经，会导致神经纤维的髓鞘发生变性，使得神经冲动的传导发生短路，从而引发疼痛。例如，有研究通过神经影像学检查发现，在三叉神经痛患者中，存在责任血管压迫的比例较高，通过对大量病例的分析统计，约80%-90%的原发性三叉神经痛患者能找到责任血管。
年龄因素：随着年龄的增长，血管会发生一定程度的退变，弹性下降，更容易发生迂曲、移位等情况，从而增加了对三叉神经的压迫几率。一般来说，中老年人发生血管压迫导致三叉神经痛的风险相对较高。
生活方式：长期的高血压等疾病会进一步加重血管的病变，增加血管对神经的压迫风险。如果患者本身有高血压，血压长期控制不佳，血管壁承受的压力增大，血管更容易发生变形，进而压迫三叉神经。
神经结构异常因素
脱髓鞘改变
三叉神经感觉根或半月节部位发生脱髓鞘病变时，神经纤维的绝缘作用受到破坏，神经冲动在传导过程中容易出现短路现象。当相邻的神经纤维之间发生冲动的异常交叉传导时，就会产生异常的神经冲动，从而引发疼痛。在显微镜下可以观察到三叉神经感觉根处存在脱髓鞘改变，这是导致神经冲动异常传导的重要病理基础。
病史因素：一些既往有神经系统感染性疾病等病史的患者，可能更容易出现神经的脱髓鞘改变。比如既往有带状疱疹病毒感染累及三叉神经区域的患者，病毒感染可能会引发免疫反应，导致神经的脱髓鞘改变，进而增加三叉神经痛的发病风险。
性别因素：一般来说，女性在更年期等特殊生理时期，体内激素水平发生变化，可能会影响神经系统的稳定性，相对男性而言，在相同的神经结构异常情况下，更容易受到影响而发生三叉神经痛。
其他因素
遗传因素
有研究发现，三叉神经痛可能存在一定的遗传易感性。部分家族性三叉神经痛患者中，发现了一些与三叉神经痛发病相关的基因位点异常。虽然遗传因素在三叉神经痛发病中所占比例相对较小，但对于有家族史的人群来说，其发病风险会有所增加。
年龄因素：家族性三叉神经痛患者的发病年龄可能相对较早，这与遗传基因的传递和表达以及个体的发育等因素有关。
生活方式：即使有遗传易感性，如果生活方式健康，如保持良好的作息、合理饮食等，可能会在一定程度上延缓发病或者减轻症状。但如果生活方式不健康，如长期熬夜、过度劳累等，会加重遗传因素带来的发病风险。
肿瘤因素
颅底肿瘤、桥小脑角肿瘤等可能会压迫三叉神经，从而引发三叉神经痛。例如，胆脂瘤、脑膜瘤等肿瘤生长过程中，会逐渐对三叉神经造成压迫，导致神经传导异常，引起疼痛。通过头颅磁共振成像等检查手段，可以发现肿瘤的存在以及其与三叉神经的关系。
病史因素：有头部肿瘤病史或者其他相关肿瘤家族史的人群，发生肿瘤压迫导致三叉神经痛的风险相对较高。对于这类人群，需要定期进行头颅相关检查，以便早期发现肿瘤病变。
性别因素：一般来说，不同性别在肿瘤相关的三叉神经痛发病上并没有明显的特异性差异，但不同类型的肿瘤在不同性别中的发病率可能有所不同，从而间接影响三叉神经痛的发病情况。
