卵巢囊肿的形成原因包括生理性因素（如卵泡囊肿、黄体囊肿）、病理性因素（如子宫内膜异位囊肿、炎症性囊肿、肿瘤性囊肿）以及其他因素（如内分泌因素、生活方式因素、遗传因素）。生理性因素中卵泡囊肿因卵泡未正常破裂排卵形成，黄体囊肿与排卵后黄体正常转归异常有关；病理性因素里子宫内膜异位囊肿由异位内膜出血形成，炎症性囊肿因盆腔炎症累及卵巢所致，肿瘤性囊肿包括上皮性和生殖细胞肿瘤等；其他因素中内分泌失衡、不良生活方式及遗传等均会影响卵巢功能或导致激素失衡进而增加囊肿发生风险。
一、生理性因素
1.卵泡囊肿
正常情况下，卵泡发育成熟后会排卵，如果卵泡没有破裂排卵，继续生长就可能形成卵泡囊肿。女性每个月经周期都会有卵泡发育，这是比较常见的生理性卵巢囊肿形成原因，一般在月经周期的特定阶段出现，多数可自行消失。
对于育龄女性，尤其是月经周期不规律的女性，卵泡囊肿的发生与卵泡发育和排卵的正常生理过程出现小的波动有关。例如，某些女性可能由于内分泌调节的轻微失衡，导致卵泡未能正常破裂排卵，从而形成囊肿。
2.黄体囊肿
在排卵后，卵泡壁会塌陷形成黄体。如果黄体血肿吸收不全，或者黄体持续存在，就可能形成黄体囊肿。黄体囊肿在怀孕早期也较为常见，因为怀孕后黄体功能会持续存在以维持妊娠。
对于有生育计划的女性，怀孕时出现的黄体囊肿与妊娠期间的内分泌变化密切相关。而对于非孕期女性，黄体囊肿的形成与排卵后的黄体正常生理转归异常有关，可能与体内激素水平的短暂波动有关。
二、病理性因素
1.子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
子宫内膜组织异位到卵巢上，随着月经周期反复出血，就会形成囊肿，囊肿内含有类似巧克力样的陈旧血性液体。子宫内膜异位症的发生机制尚不完全明确，但与经血逆流等因素有关。
对于有过宫腔操作史（如人工流产等）的女性，经血逆流进入盆腔的风险可能增加，从而增加子宫内膜异位到卵巢形成巧克力囊肿的几率。育龄女性，尤其是有痛经进行性加重等症状的女性，需要警惕子宫内膜异位囊肿的可能。
2.炎症性囊肿
盆腔炎症累及卵巢时，炎症刺激可导致卵巢与周围组织粘连，炎性渗出物积聚形成囊肿。常见的盆腔炎病原体有淋病奈瑟菌、衣原体等。
性生活活跃的女性，尤其是不注意性生活卫生的女性，容易发生盆腔炎症，进而引发卵巢炎症性囊肿。例如，多个性伴侣、性生活过早等因素都可能增加盆腔感染的风险，从而导致炎症性卵巢囊肿的发生。
3.肿瘤性囊肿
卵巢上皮性肿瘤：包括浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤等良性肿瘤，以及浆液性囊腺癌、黏液性囊腺癌等恶性肿瘤。其发生与卵巢上皮的异常增殖有关，具体的发病机制可能涉及基因变异等因素。
对于中老年女性，卵巢上皮性肿瘤的发生风险相对较高。基因检测发现某些基因突变与卵巢上皮性肿瘤的发生相关，如BRCA1/BRCA2基因突变的女性，患卵巢癌等上皮性肿瘤的风险明显增加。
生殖细胞肿瘤：好发于年轻女性，包括畸胎瘤等。畸胎瘤是由多胚层组织构成的肿瘤，可能与生殖细胞异常分化有关。
年轻女性的生殖细胞肿瘤发生与生殖细胞在发育过程中的异常分化相关，具体机制尚在研究中，但这类肿瘤在年轻人群中相对常见。
三、其他因素
1.内分泌因素
长期的高雌激素水平刺激可能促进卵巢囊肿的形成。例如，患有多囊卵巢综合征的女性，体内雄激素水平升高，同时伴有雌激素的相对失衡，容易出现卵巢囊肿。多囊卵巢综合征患者常表现为月经不调、多毛、肥胖等症状，其卵巢往往呈多囊样改变，存在多个小卵泡发育但不易排卵，进而可能形成囊肿。
对于长期服用某些含有雌激素药物的女性，如激素替代治疗的女性，也可能因体内雌激素水平升高而增加卵巢囊肿的发生风险。
2.生活方式因素
长期的不良生活方式，如长期熬夜、过度劳累、精神压力过大等，可能影响内分泌系统的正常功能，导致激素失衡，从而增加卵巢囊肿的发生几率。例如，长期精神压力大会通过下丘脑-垂体-卵巢轴影响卵巢的正常功能，导致激素分泌紊乱。
不健康的饮食结构，如长期高脂、高糖饮食，也可能对内分泌产生不良影响。高脂饮食可能影响激素的代谢，高糖饮食可能导致胰岛素抵抗，进而影响卵巢的内分泌功能，增加卵巢囊肿的发生风险。
3.遗传因素
某些卵巢囊肿具有遗传倾向。例如，家族中有卵巢囊肿患者的女性，其发生卵巢囊肿的风险可能高于一般人群。一些遗传性综合征，如遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征等，与卵巢囊肿尤其是卵巢癌的遗传易感性相关。
对于有家族遗传病史的女性，需要更加密切地进行卵巢相关检查，以便早期发现和处理可能出现的卵巢囊肿问题。例如，携带BRCA1/BRCA2基因突变的女性，除了进行常规的妇科检查外，可能需要更频繁地进行超声等检查来监测卵巢情况。
