良性肿瘤和恶性肿瘤之间没有绝对界限，在生物学行为、分子生物学层面及临床诊断中都存在渐进和模糊情况，如生物学行为上细胞分化、生长速度、转移能力有过渡状态；分子生物学层面基因改变、信号通路异常有中间状态；临床诊断中影像学表现、病理学检查也有重叠和困难之处。
1.生物学行为差异的渐进性
细胞分化程度方面：良性肿瘤细胞分化程度较高，与起源组织的形态和功能相似，生长缓慢，多呈膨胀性生长，通常有完整包膜，与周围组织界限清楚。例如皮肤的脂肪瘤，瘤细胞分化好，形态与正常脂肪细胞相似，生长缓慢，一般不浸润周围组织。而恶性肿瘤细胞分化程度低，常表现为未分化或低分化状态，与起源组织差异大，生长速度快，常呈浸润性生长，无包膜或包膜不完整，与周围组织界限不清，易侵犯周围组织和器官。如肺癌细胞，分化程度低，可侵犯周围肺组织、血管、淋巴管等，向远处转移。但有些肿瘤的细胞分化程度处于中间状态，难以明确区分是良性还是恶性，比如胃肠道的交界性肿瘤，其细胞分化、核分裂象等指标介于良性和恶性肿瘤之间。
生长速度方面：多数良性肿瘤生长相对缓慢，在一定时间内体积增长有限。但也有特殊情况，如某些良性肿瘤在特定诱因下可能加速生长，但总体仍与恶性肿瘤的快速生长有别。恶性肿瘤生长速度往往较快，短期内可明显增大。然而，也存在一些良性肿瘤生长速度相对较快，而个别恶性肿瘤生长相对缓慢的情况，这进一步模糊了两者的界限。例如甲状腺的良性腺瘤一般生长缓慢，但个别情况下生长也会加快；而某些恶性程度较低的肿瘤，如皮肤的基底细胞癌，生长相对缓慢，与一些生长较快的良性肿瘤形成对比。
转移能力方面：良性肿瘤一般不转移，这是其重要特征之一。但也有极个别良性肿瘤存在局部侵袭性行为，如肝脏的局灶性结节性增生，虽为良性，但有局部浸润周围组织的情况。恶性肿瘤具有转移能力，可通过淋巴道、血道或种植等途径转移到身体其他部位。但也有一些恶性肿瘤的转移潜能相对较低，而某些良性肿瘤可能在特殊情况下出现类似转移的表现，例如盆腔的平滑肌瘤，少数情况下可通过血行转移到肺等远处器官，但这种情况极为罕见，且与典型的恶性肿瘤转移有本质区别。
2.分子生物学层面的过渡
基因改变情况：良性肿瘤往往存在相对局限的基因改变，通常是一些与细胞生长调控相关的基因发生轻度异常，如某些抑癌基因的轻度失活或原癌基因的轻度激活等，这些改变一般不足以导致肿瘤的恶性表型，但已显示出与正常组织基因状态的差异。例如视网膜母细胞瘤中，RB基因的突变在良性和恶性阶段有不同程度的表现，良性的视网膜错构瘤可能存在RB基因的部分突变，而恶性的视网膜母细胞瘤则有更严重的RB基因改变。恶性肿瘤则有一系列复杂的基因改变，包括多个原癌基因的激活（如ras基因家族的激活）和多个抑癌基因的失活（如p53基因的突变、缺失等），且基因改变的数量和程度更为显著和多样。然而，在一些交界性肿瘤中，基因改变处于良性和恶性之间的状态，既有一定程度的原癌基因激活，又有部分抑癌基因的失活，但尚未达到典型恶性肿瘤的基因改变程度。
信号通路异常方面：良性肿瘤的信号通路异常相对较为单一和局限，主要影响细胞的生长和增殖调控。例如Wnt信号通路在一些良性肿瘤中可能出现轻度异常，导致细胞轻度增殖活跃。恶性肿瘤的信号通路异常则非常复杂，涉及多个信号通路的紊乱，如PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等的广泛异常，这些通路的异常导致细胞过度增殖、抗凋亡、侵袭和转移等多种恶性表型。但同样存在一些肿瘤的信号通路异常处于良性和恶性之间，其信号通路的激活程度和范围不如典型恶性肿瘤那么广泛和强烈，如某些交界性卵巢肿瘤的信号通路改变介于良性和恶性卵巢肿瘤之间。
3.临床诊断中的模糊地带
影像学表现差异的重叠：良性肿瘤在影像学上通常表现为边界清晰、形态规则的占位病变，如B超下肝囊肿表现为边界清晰的无回声区，CT上脂肪瘤呈低密度影且边界清楚。恶性肿瘤多表现为边界不清、形态不规则、有毛刺征等表现，如肺癌在CT上常表现为边缘有毛刺的肿块。但也有一些肿瘤的影像学表现不典型，介于两者之间。例如肺部的炎性假瘤，影像学上有时难以与周围型肺癌区分，其边界可能不太清晰，形态也有一定的不规则性，类似恶性肿瘤的表现，但实际上是良性病变。对于一些儿童的腹部肿瘤，良性和恶性肿瘤在影像学上的差异有时也不十分典型，需要结合临床其他资料进一步判断。
病理学检查的困难：常规病理学检查中，虽然有一些基本的指标来区分良性和恶性肿瘤，如细胞分化程度、核分裂象等，但在实际操作中，很多情况难以明确界定。例如乳腺的导管内乳头状瘤，部分区域细胞有一定程度的异型性，但又不足以诊断为恶性，属于交界性病变。在儿科肿瘤中，由于儿童肿瘤的生物学行为与成人有一定差异，良性和恶性肿瘤的区分有时更加复杂。儿童的神经母细胞瘤有不同的生物学行为，部分低危型神经母细胞瘤的恶性程度相对较低，与一些良性肿瘤的鉴别需要综合考虑多种因素，包括肿瘤的基因表达谱、临床病程等多方面情况，这进一步体现了良性和恶性肿瘤之间界限的不绝对。
