斑秃的发病与遗传、自身免疫、神经精神、内分泌失调及其他等多种因素相关。遗传约使25%患者有家族史；自身免疫是关键，免疫系统异常攻击毛囊，Th1和Th2失衡起重要作用；神经精神因素中，长期压力过大等可通过神经内分泌系统影响毛囊；内分泌失调方面，甲状腺功能异常、性激素水平变化均有影响；其他因素包括感染及长期接触化学物质、辐射等环境因素也可能增加发病风险。
自身免疫因素
免疫系统异常攻击毛囊：自身免疫功能紊乱是斑秃发生的关键因素之一。人体的免疫系统错误地将毛囊当成了外来入侵的物质，从而发起攻击。例如，T淋巴细胞等免疫细胞会对毛囊细胞进行破坏，导致毛囊进入休止期，毛发停止生长，进而出现斑秃的症状。许多自身免疫性疾病常与斑秃伴发，如甲状腺疾病等，这也从侧面反映了自身免疫因素与斑秃的密切联系。
免疫相关细胞的作用：辅助性T细胞1（Th1）和辅助性T细胞2（Th2）的失衡在斑秃的自身免疫发病机制中起重要作用。正常情况下，Th1和Th2处于平衡状态，共同调节机体的免疫反应。但在斑秃患者中，这种平衡被打破，Th1细胞活性增强，它们分泌的细胞因子会进一步加剧对毛囊的免疫损伤。
神经精神因素
精神压力的影响：长期的精神压力过大可能诱发斑秃。例如，突然遭受重大生活事件，如亲人离世、失业、严重的家庭纠纷等，会使人体处于高度应激状态，体内的神经内分泌系统发生改变，释放出如儿茶酚胺等物质，这些物质会影响毛囊的血液供应和毛囊的生长周期，从而导致斑秃的发生。研究发现，在经历重大精神创伤后的人群中，斑秃的发病率明显升高。
神经调节与毛囊的关系：神经系统与毛囊之间存在复杂的神经-体液调节通路。当神经精神因素导致神经递质失衡时，会通过影响毛囊周围的神经纤维和血管，干扰毛囊的正常生理功能。比如，去甲肾上腺素等神经递质的异常变化可能影响毛囊的营养供应和毛囊干细胞的活性，进而引发斑秃。
内分泌失调因素
甲状腺功能异常：甲状腺激素对毛囊的生长和代谢有着重要的调节作用。甲状腺功能亢进或减退都可能导致斑秃。甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，会加速机体的代谢，影响毛囊的正常生长周期；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，毛囊的生长速度减慢，容易进入休止期，从而引发斑秃。有研究显示，约5%-10%的斑秃患者合并有甲状腺功能异常。
性激素水平的影响：性激素也与斑秃有关。雄激素水平异常可能在男性斑秃发病中起作用，而雌激素等女性激素的变化也可能影响女性斑秃的发生。例如，在青春期后的男性斑秃患者中，可能存在雄激素代谢的异常，导致毛囊微小化，毛发变细变软，最终脱落。女性在妊娠期时，体内性激素水平发生变化，部分女性在产后可能出现斑秃，这与产后性激素水平的急剧变化有关。
其他因素
感染因素：某些病毒、细菌等感染可能与斑秃的发生相关。例如，有研究发现，斑秃患者头皮处的金黄色葡萄球菌携带率较高，而且这些细菌可能通过释放某些毒素或引起局部免疫反应，间接影响毛囊的健康。另外，一些病毒感染，如人类免疫缺陷病毒（HIV）感染早期也可能出现斑秃样表现，但这并不是普遍的因果关系，只是在特定情况下的关联。
环境因素：长期暴露在某些化学物质、辐射等环境因素下也可能增加斑秃的发病风险。例如，长期接触染发剂、杀虫剂等化学物质的人群，其毛囊受到这些化学物质的损伤，容易引发斑秃。此外，长期处于辐射环境中，如接受过量的医用辐射等，也可能对毛囊细胞造成损害，导致斑秃的发生。
