沙眼急性期有畏光流泪异物感、结膜充血及乳头增生，儿童患者可能频繁揉眼，免疫力较低人群症状更明显；慢性期有结膜瘢痕形成、角膜血管翳影响视力、眼痒干涩等不适，长期用眼习惯不良者角膜血管翳影响更甚，女性激素变化时眼部不适会波动；晚期并发症有睑内翻及倒睫刺激角膜，角膜混浊影响视力，沙眼病变致干眼，结膜瘢痕收缩引起睑球粘连影响眼球运动，老年人易现睑内翻及倒睫，从事对视力要求高职业者角膜混浊影响大，全身免疫性疾病患者易现干眼，儿童发生睑球粘连影响眼部发育和视功能。
急性期症状
畏光、流泪、异物感：患者常感觉眼睛怕光，不自觉地流泪，同时眼睛里有明显的异物感，就好像有沙子等东西在里面一样。这是因为沙眼衣原体感染眼部结膜后，引发炎症反应，刺激眼表神经末梢，导致出现这些症状。儿童患者由于表达能力相对较弱，可能会表现出频繁揉眼等行为来试图缓解不适。
结膜充血及乳头增生：结膜会出现明显的充血现象，呈现出鲜红色，同时还能看到结膜表面有许多细小的乳头增生，外观上看起来结膜不平。对于有基础眼部疾病或者免疫力较低的人群，如患有糖尿病的患者，感染沙眼衣原体后，急性期症状可能会更为明显，因为高血糖环境可能影响机体的免疫防御功能，使得炎症反应加剧。
慢性期症状
结膜瘢痕形成：随着病情的发展，进入慢性期后，结膜会逐渐形成瘢痕。这是沙眼的一个较为典型的特征性表现。在眼部检查时可以观察到结膜表面有白色的瘢痕组织。不同年龄段的人群，瘢痕形成的速度和表现可能有所不同，一般来说，儿童的组织修复能力相对较强，但如果沙眼感染未得到有效控制，瘢痕形成也会逐渐出现。
角膜血管翳：角膜上会出现新生血管，称为角膜血管翳。这些血管从角膜边缘侵入角膜，影响视力。对于有长期用眼习惯不良的人群，如长时间使用电子设备的人，感染沙眼后角膜血管翳的形成可能会对视力产生更明显的影响，因为不良用眼习惯可能会进一步加重眼部的不适和炎症反应。
眼痒、干涩等不适：患者会感觉眼睛发痒、干涩，眼部的舒适度明显下降。这种不适症状可能会持续存在，尤其是在环境干燥或者长时间用眼后会加重。对于女性患者，在月经周期等激素水平变化时期，眼部的不适可能会有所波动，因为激素变化可能会影响眼部的泪液分泌等功能，从而加重沙眼带来的不适症状。
晚期并发症症状
睑内翻及倒睫：由于结膜瘢痕收缩，可导致睑内翻，进而引起倒睫。倒睫会刺激角膜，引起疼痛、畏光、流泪等症状，长期的倒睫刺激还可能导致角膜溃疡等严重并发症。老年人由于眼部组织的退行性变，更容易出现睑内翻及倒睫的情况，而且一旦发生，处理起来相对复杂，因为其眼部组织的弹性等功能下降。
角膜混浊：严重的角膜血管翳和反复的炎症刺激可导致角膜混浊，明显影响视力。对于从事对视力要求较高职业的人群，如司机、画家等，角膜混浊会严重影响其正常工作和生活，需要及时进行干预治疗。
干眼：沙眼病变破坏了眼表的杯状细胞等结构，导致泪液分泌减少，引发干眼。干眼会使患者眼睛更加干涩、异物感明显，还可能出现视力波动等情况。对于患有全身免疫性疾病的人群，如类风湿关节炎患者，本身就存在免疫功能紊乱，感染沙眼后更容易出现干眼等并发症，因为免疫因素会进一步影响眼表的正常结构和功能。
睑球粘连：结膜瘢痕收缩可引起睑球粘连，影响眼球的运动。这会对患者的眼部功能产生较大影响，导致眼球活动受限，进而影响日常生活和工作。儿童如果发生睑球粘连，可能会影响其眼部的正常发育和视功能的发展，需要尽早进行评估和干预。
