肝囊肿与肝癌在发病机制与来源、影像学表现、血液肿瘤标志物、临床表现及穿刺活检等方面存在差异，肝囊肿多为先天性、生长缓慢、标志物无异常、症状轻，肝癌与多种因素相关、有特定影像学及标志物表现、症状相对重且穿刺可发现癌细胞。
一、发病机制与来源差异
肝囊肿：多为先天性，是肝脏内出现的含有液体的囊状结构，由胚胎发育时期胆管异常演变而来，也有部分与炎症、创伤等因素有关，其生长较为缓慢，通常为良性病变，不会像恶性肿瘤那样无限制地浸润周围组织或转移。不同年龄段人群都可能发生，生活方式一般不直接导致肝囊肿的形成，但长期不良生活方式可能影响肝脏整体健康状况间接相关。
肝癌：主要包括原发性肝癌和继发性肝癌，原发性肝癌的发生与多种因素相关，如慢性乙型肝炎病毒或丙型肝炎病毒感染、长期大量饮酒、食用被黄曲霉毒素污染的食物、患有肝硬化等。继发性肝癌是其他部位的恶性肿瘤转移至肝脏所致。一般多见于有基础肝病（如乙肝、丙肝）病史、长期酗酒、长期食用霉变食物等特定人群，男性相对女性可能有更高的发病风险，与不同性别激素水平及生活方式偏好等因素有关。
二、影像学表现区别
肝囊肿：在超声检查中表现为肝脏内边界清晰的无回声区，囊壁薄而光滑；CT检查呈圆形或类圆形低密度影，密度均匀，增强扫描时无强化；MRI检查T1加权像呈低信号，T2加权像呈高信号，边界清楚。
肝癌：超声检查时，肝癌通常表现为低回声、高回声或混合回声结节，边界多不清晰，周边可能有低回声晕；CT检查平扫多为低密度灶，动脉期常出现明显强化，门静脉期或延迟期强化迅速消退，呈现“快进快出”的特点；MRI检查T1加权像多为低信号，T2加权像多为稍高信号，增强扫描特征与CT类似，也是动脉期强化，静脉期或延迟期对比剂洗脱。
三、血液肿瘤标志物差异
肝囊肿：血清肿瘤标志物一般无明显异常，甲胎蛋白（AFP）通常在正常范围内，其他相关肿瘤标志物也无特异性升高。
肝癌：原发性肝癌时，甲胎蛋白（AFP）明显升高具有重要提示意义，尤其是AFP大于400μg/L持续四周以上、或AFP在200-400μg/L之间持续八周以上，并排除妊娠、活动性肝病、生殖腺胚胎源性肿瘤等情况时，高度提示肝癌可能；同时，还可能有异常凝血酶原（DCP）等其他肿瘤标志物的改变，而继发性肝癌则取决于原发肿瘤的标志物情况，若原发肿瘤是胃肠道肿瘤等，相关糖类抗原可能升高。
四、临床表现不同
肝囊肿：较小的肝囊肿通常无明显症状，多在体检时发现。当囊肿增大到一定程度时，可能会压迫周围组织，引起右上腹隐痛、胀满等不适，一般症状相对较轻且进展缓慢。不同年龄人群囊肿增大出现症状的时间可能不同，老年人可能因肝脏代偿功能相对较弱等因素，囊肿较小时也可能出现症状。
肝癌：早期肝癌可能症状不典型，随着病情进展，患者可出现右上腹疼痛，多为持续性胀痛或钝痛；还可能伴有消瘦、乏力、食欲减退、腹胀等全身及消化道症状，部分患者会出现黄疸（皮肤、巩膜黄染）、肝大等体征。有基础肝病的人群出现上述症状时需高度警惕肝癌可能，不同年龄患者症状出现的早晚和表现程度会因个体差异及基础健康状况不同而有所不同，比如老年肝癌患者可能全身状况更差，症状相对更明显且进展较快。
五、穿刺活检鉴别
肝囊肿：通过穿刺可抽出清亮、无色、透明的液体，液体常规检查无肿瘤细胞等异常，生化检查显示为单纯的囊液成分。
肝癌：穿刺活检可找到癌细胞，根据癌细胞的形态、病理类型等明确肝癌的具体分型等情况，从而确诊肝癌。但穿刺活检属于有创检查，需要严格掌握适应证，对于凝血功能严重异常等人群要谨慎操作。
