孕囊发育迟缓可能由染色体异常（胚胎自身或父亲精子染色体异常）、母体因素（内分泌异常、子宫异常、感染因素、不良生活方式）、环境因素（长期处于高辐射或接触大量有毒化学物质环境）导致，胚胎自身染色体异常或父亲精子染色体异常可致发育迟缓，母体内分泌、子宫、感染、不良生活方式及环境高辐射、有毒化学物质接触均会影响孕囊发育。
染色体异常：胚胎自身染色体异常是导致孕囊发育迟缓常见的原因之一。正常的胚胎发育依赖于染色体的正常遗传信息传递，若染色体数目或结构存在异常，会影响胚胎的正常生长发育进程，从受精卵形成阶段就可能出现问题，比如在减数分裂过程中染色体不分离等情况，使得胚胎携带异常染色体，进而影响孕囊的发育。这种情况在各个年龄段的备孕人群中都可能发生，但年轻女性相对而言染色体异常概率相对较低，随着年龄增长，尤其是35岁以上的女性，卵子质量下降，染色体异常的几率会明显增加，导致孕囊发育迟缓的风险升高。
母体因素
内分泌异常：如黄体功能不全，黄体分泌的孕激素对于维持妊娠至关重要，若黄体功能不足，孕激素分泌量不足，不能为孕囊的着床和发育提供良好的内分泌环境，就可能导致孕囊发育迟缓。甲状腺功能异常也是一个重要因素，甲状腺素参与机体的新陈代谢等多种生理过程，甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，会影响胚胎的生长发育；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺素水平也可能干扰胚胎的正常发育进程。对于有内分泌疾病病史的女性，比如既往有甲状腺疾病、多囊卵巢综合征等，在备孕前需要积极控制病情，将内分泌指标调整到合适范围后再怀孕，以降低孕囊发育迟缓的风险。
子宫异常：子宫是孕囊着床和发育的场所，如果子宫存在畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会影响孕囊的正常着床位置和空间，导致孕囊发育受限；子宫内膜薄，不利于孕囊的种植和营养获取，也会影响孕囊发育，常见于多次人工流产导致子宫内膜损伤的女性，这类女性子宫内膜修复不佳，厚度不够，影响孕囊发育。对于有子宫异常的女性，需要根据具体情况进行相应的评估和处理，比如通过手术矫正子宫畸形等。
感染因素：孕期受到某些病原体感染，如TORCH感染（包括弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等），病原体可通过胎盘感染胚胎，影响孕囊的发育。例如孕妇感染风疹病毒，在怀孕早期感染可能导致胚胎发育畸形、孕囊发育迟缓等。女性在备孕前应进行TORCH筛查，孕期注意避免接触可能感染的源，如避免接触宠物、注意个人卫生等，降低感染风险。
不良生活方式：长期吸烟、酗酒的女性，烟草中的尼古丁和酒精会对胚胎发育产生不良影响，烟草中的有害物质可导致血管收缩，影响子宫胎盘的血液循环，使孕囊得不到充足的营养供应；酒精会干扰胚胎的代谢过程，导致孕囊发育迟缓。还有长期熬夜、过度劳累的女性，身体处于应激状态，内分泌紊乱，也可能影响孕囊发育。备孕及孕期女性应保持健康的生活方式，戒烟戒酒，规律作息，避免过度劳累。
父亲因素：男性精子染色体异常也可能影响孕囊发育，虽然相对女性因素影响较小，但也是一个不可忽视的方面。男性长期接触有害物质，如重金属、化学毒物等，或存在生殖系统疾病等，都可能导致精子质量下降，染色体异常概率增加，从而影响受精卵的发育，导致孕囊发育迟缓。男性在备孕前也应注意避免接触有害物质，保持健康的生活方式，进行精液常规等检查，确保精子质量良好。
环境因素：长期处于高辐射环境、接触大量有毒化学物质等环境因素也可能导致孕囊发育迟缓。例如在辐射工作场所工作的女性，孕期继续接触高辐射环境，辐射会损伤胚胎细胞，影响孕囊发育；长期接触农药、甲醛等有毒化学物质的人群，这些物质可能通过呼吸道或皮肤吸收进入体内，干扰胚胎的正常发育过程。备孕及孕期女性应尽量远离高辐射、有毒化学物质污染的环境。
