影响先天性脑发育不良痊愈几率的因素有病情严重程度（轻度相对稍高、中重度极低）、病因差异（可纠正病因相对提升、遗传等不可纠正病因极低）、干预治疗时机（早期干预利于提升几率、时机晚则降低）；不同人群特点影响包括年龄因素（婴幼儿期可塑性大、学龄期及以后降低）、性别无显著固有差异、生活方式（康复训练依从性影响几率）及病史（有其他并发症会降低几率）。
一、影响先天性脑发育不良痊愈几率的因素
（一）病情严重程度
1.轻度脑发育不良：若病变范围局限且程度较轻，例如仅存在轻微的脑沟回发育稍异常等情况，在早期通过规范的康复训练等干预措施，有一定几率实现功能的部分改善，痊愈几率相对稍高，但也难以达到完全正常，可能能达到接近正常的功能状态，不过具体几率因个体差异而异，一般在部分患儿中可获得一定程度的功能提升。
2.中重度脑发育不良：当出现明显的大脑结构严重异常、伴有严重的运动功能障碍、智力显著低下等情况时，痊愈几率极低。此类患儿往往会遗留永久性的功能缺陷，如严重的肢体瘫痪、重度智力障碍等，因为脑部的严重损伤已造成不可逆的神经结构改变，很难通过治疗达到完全正常的痊愈状态。
（二）病因差异
1.可纠正病因：如果先天性脑发育不良是由可纠正的因素引起，比如孕期母亲缺乏某些重要营养素导致胎儿脑发育受影响，在出生后及时补充相应营养素并配合早期康复干预，部分患儿有可能获得较好的恢复，痊愈几率相对有所提升，但也难以达到完全正常，可能会遗留一定程度的轻微缺陷。
2.遗传或不可纠正病因：若是由遗传因素导致的先天性脑发育不良，如某些遗传性基因缺陷引起的脑发育异常，由于基因层面的异常难以逆转，痊愈几率非常低。此类患儿通常会伴随持续的严重功能障碍。
（三）干预治疗时机
1.早期干预：出生后尽早发现并开始干预治疗，例如在婴儿期就启动康复训练、营养支持等综合干预措施，对于轻度或部分中轻度的先天性脑发育不良患儿，能够最大程度地促进神经功能的恢复，提高改善的几率，虽然很难完全痊愈，但能显著改善预后，提升生活自理及部分功能能力。
2.干预时机较晚：若错过了早期干预的最佳时期，等到患儿年龄较大才开始治疗，此时脑部的可塑性降低，神经修复困难，痊愈几率会大大降低，往往只能改善部分症状，难以达到理想的完全正常的痊愈状态。
二、不同人群特点对痊愈几率的影响
（一）年龄因素
1.婴幼儿期：婴幼儿时期脑部处于快速发育阶段，具有一定的可塑性，此时进行干预治疗，神经功能恢复的潜力较大，相比年龄较大的儿童或成人，对于轻度脑发育不良患儿有更高的改善几率，但对于严重脑发育不良的患儿，即便早期干预，也难以实现完全痊愈，只能尽量改善功能障碍程度。
2.学龄期及以后：随着年龄增长，脑部发育逐渐成熟，可塑性降低，一旦错过婴幼儿期的最佳干预时机，在学龄期及以后进行治疗，神经修复难度增大，痊愈几率大幅降低，更多是针对已有的功能障碍进行改善和康复训练，以提高生活适应能力，但很难达到完全正常的痊愈状态。
（二）性别因素
先天性脑发育不良的痊愈几率在性别上并无显著的固有差异，痊愈几率主要取决于病情本身的严重程度、病因以及干预治疗等因素，而非单纯由性别决定。不过不同性别的患儿在面对相同病情时，可能因个体的身体状况、对治疗的反应等略有不同，但这种差异并非是性别导致的根本性差异。
（三）生活方式及病史因素
1.生活方式：患儿在治疗过程中的康复训练依从性等生活方式因素会影响痊愈几率。例如，积极配合康复训练的患儿，相比依从性差的患儿，更有可能获得较好的功能改善，从而提升痊愈的相对几率；而不配合训练的患儿，痊愈几率会受到不利影响。
2.病史：若患儿同时伴有其他并发症，如癫痫等，会增加治疗的复杂性，影响痊愈几率。因为并发症的存在需要同时进行处理，可能会分散治疗资源，并且并发症本身也会对脑功能产生进一步的影响，使得痊愈几率降低；而没有其他严重并发症的患儿，在单纯针对脑发育不良进行治疗时，相对更有可能获得较好的恢复几率。
