治疗慢性胃炎和结肠炎的药物有抑酸护胃药物（包括质子泵抑制剂和H受体拮抗剂）、胃黏膜保护药物（如铝碳酸镁、硫糖铝）、调节肠道菌群药物（益生菌制剂）、抗生素类药物（幽门螺杆菌感染相关时用），选择药物需综合患者多方面因素，且非药物干预如健康生活方式对康复关键。
一、抑酸护胃药物
质子泵抑制剂：如奥美拉唑等，通过抑制胃壁细胞上的质子泵，减少胃酸分泌，可缓解慢性胃炎、结肠炎患者因胃酸过多引起的胃痛、反酸等症状。大量临床研究表明，质子泵抑制剂能有效降低胃内酸度，促进胃黏膜和结肠黏膜损伤的修复，其抑酸作用持久且强效，适用于伴有明显反酸、烧心等症状的患者，但对于儿童等特殊人群需谨慎使用，应在医生评估后根据具体情况决定是否使用。
H受体拮抗剂：像雷尼替丁等，通过竞争抑制胃壁细胞上的H受体，减少胃酸分泌，对缓解胃部不适有一定作用，可用于轻至中度症状的慢性胃炎、结肠炎患者缓解症状，但相比质子泵抑制剂，其抑酸作用相对较弱且持续时间较短，在特殊人群如老年人等使用时也需注意药物相互作用等问题。
二、胃黏膜保护药物
铝碳酸镁：能迅速中和胃酸，并在胃黏膜表面形成保护膜，覆盖于溃疡或炎症部位，起到保护胃黏膜和结肠黏膜的作用，可缓解胃痛、胃胀、胃灼热等症状，还能吸附胆汁酸等，对于伴有胆汁反流的慢性胃炎、结肠炎患者有较好的疗效，该药物安全性相对较高，但孕妇等特殊人群使用前需咨询医生。
硫糖铝：在酸性环境下可解离出硫酸蔗糖复合离子，能与溃疡或炎症处的蛋白质结合形成保护膜，保护胃黏膜和结肠黏膜免受胃酸、胆汁等的侵蚀，适用于慢性胃炎、结肠炎伴有黏膜损伤的患者，但肾功能不全的患者长期大量使用可能会引起铝蓄积，需加以关注，儿童使用时也需遵循儿科用药原则。
三、调节肠道菌群药物
益生菌制剂：例如双歧杆菌四联活菌片等，肠道菌群失调在慢性胃炎和结肠炎的发病中可能起到一定作用，益生菌可以调节肠道菌群平衡，改善肠道微生态环境，增强肠道屏障功能，有助于缓解结肠炎患者的腹泻、腹痛等症状，也对慢性胃炎患者的胃肠功能调节有一定帮助，对于儿童患者，可选择适合儿童的益生菌制剂，但需注意正确的储存和服用方法以保证药效，特殊人群如免疫力低下的老年人等使用时也需考虑自身整体健康状况与药物的相互影响。
四、抗生素类药物
对于幽门螺杆菌感染相关的情况：如果慢性胃炎合并幽门螺杆菌感染，常需要使用抗生素联合治疗，如阿莫西林等，但抗生素的使用必须严格遵循指征，根据药敏试验等结果合理选用，因为不恰当使用抗生素可能导致肠道菌群进一步失调等问题，儿童患者若存在幽门螺杆菌感染相关情况，抗生素的选择和使用需格外谨慎，要充分评估利弊后在医生指导下使用。
在选择药物治疗慢性胃炎和结肠炎时，需要综合考虑患者的年龄、性别、病史等多方面因素，比如女性患者在孕期、哺乳期用药需特别谨慎，有肝肾功能不全病史的患者使用某些药物时要调整剂量或选择合适药物，同时非药物干预也很重要，如保持健康的生活方式，规律作息、合理饮食（避免辛辣、油腻、刺激性食物等）对于疾病的康复也起着关键作用，应在药物治疗的基础上结合良好的生活方式调整来促进病情的改善。
