巧囊自破有多种症状，会突然出现一侧下腹剧烈疼痛，还伴有盆腔刺激症状如坠胀感、肛门坠胀，有恶心、呕吐等其他伴随症状，少数有阴道少量出血，极少数会出现休克表现，不同年龄段及生活方式不同者表现有差异，年轻、中老年及有相关病史未规范治疗者风险不同。
疼痛特点：巧囊自破时，患者多会突然出现一侧下腹的剧烈疼痛，这种疼痛往往较为尖锐、难忍，且疼痛程度可能会逐渐加剧。从生理机制来讲，巧克力囊肿破裂后，囊内的液体流入盆腔，刺激腹膜，从而引发强烈的腹痛。例如，有研究表明，约70%巧囊自破的患者会首先出现突发的下腹疼痛症状。
年龄因素影响：不同年龄段的患者腹痛表现可能有一定差异。年轻女性由于痛觉敏感度可能相对较高，对疼痛的感知可能更为强烈；而中老年女性可能对疼痛的耐受性稍有不同，但总体还是以剧烈的下腹疼痛为主要表现。
生活方式影响：如果患者近期有剧烈运动等情况，可能会增加巧囊自破引发腹痛的风险，且在自破时腹痛会更为突然和剧烈。
盆腔刺激症状
坠胀感：患者会感觉下腹部有明显的坠胀不适，这是因为巧克力囊肿内的液体刺激盆腔腹膜等组织所致。这种坠胀感会让患者感觉腹部沉重，活动时可能会加重。
肛门坠胀：部分患者还可能出现肛门坠胀感，这是由于盆腔内的刺激波及直肠周围组织引起的。患者会有总想排便但又排不净的感觉，与巧囊破裂后液体刺激直肠附近的腹膜有关。
其他伴随症状
恶心、呕吐：由于腹痛等不适刺激，患者可能会出现恶心、呕吐的症状。这是机体的一种应激反应，因为剧烈的腹痛会通过神经传导引起胃肠道的反应。例如，一些巧囊自破的患者在出现腹痛的同时，就会伴有恶心、呕吐的情况。
阴道少量出血：少数患者可能会出现阴道少量出血的情况，这是因为巧囊破裂后，盆腔内环境发生变化，影响了生殖系统的正常状态。但这种阴道出血一般量不多，与正常月经不同。
休克表现（罕见情况）：在极少数情况下，尤其是巧囊破裂出血较多时，患者可能会出现休克相关表现，如面色苍白、血压下降、心率加快等。这是因为大量出血导致有效循环血量减少，进而引起休克，这种情况需要紧急处理。例如，有文献报道，约1%的巧囊自破患者会出现休克表现，多是由于破裂口较大，出血迅猛所致。对于年轻患者，由于身体代偿能力相对较好，若出现休克可能提示病情更为危急；而中老年患者本身可能存在一些基础疾病，休克的发生会加重病情的复杂性和严重性。生活方式不健康、有巧囊病史且未规范治疗的患者，巧囊自破后出现休克等严重情况的风险相对更高。
