昆明感染内科医院排名比较靠前的是云南省传染病医院、昆明市第三人民医院、昆明医科大学第一附属医院。
云南省传染病医院感染科是省级临床重点专科，在艾滋病及合并症诊疗上技术领先，科研与荣誉成果丰硕。昆明市第三人民医院感染性疾病及儿童传染病科在中枢神经系统感染、虫媒病等领域省内率先突破，是昆明传染病防控核心力量。昆明医科大学第一附属医院感染性疾病科为省级重点专科，人工肝技术全国先进，抗疫与教学科研实力突出。
1.云南省传染病医院 感染科云南省传染病医院感染科含感染一科与感染二科，感染一科为省级临床重点专科，获青年文明号、优质护理病房等称号，率先开展艾滋病相关多项新技术，收治大量疑难危重患者，主持参与二十余项国家及省级科研项目，抗疫期间多人获国家级省级表彰。感染二科承担国家多期艾滋病防治重大专项，艾滋病合并血液系统肿瘤治疗有效率达国内领先水平，为省内外医师培训基地，诊疗口碑辐射全国。
2.昆明市第三人民医院 感染性疾病及儿童传染病科昆明市第三人民医院感染性疾病及儿童传染病科是昆明医学会感染性疾病分会主委单位、省市重点学科成员单位，擅长60余种感染性疾病诊疗。在云南省率先开展中枢神经系统感染多项微创诊疗技术，率先研究登革热疟疾免疫机制并临床应用，开展布鲁菌病并发症介入治疗，开设儿童潜伏结核筛查专科。处置多起公共卫生事件，发表多篇核心及SCI论文，主编多部专著，常年举办国家级及省级继续教育项目。
3.昆明医科大学第一附属医院 感染性疾病科昆明医科大学第一附属医院感染性疾病科为省级临床重点专科、博硕士学位授予点、国家药物临床试验专业，获全国科学大会奖等多项荣誉。是省级突发公共卫生事件定点收治单位、综合医院唯一新冠定点收治单位，获评多项抗疫先进集体。人工肝技术全省领先、全国先进，为全国人工肝示范中心，拥有云岭名医等高层次人才，参与编写多部全国肝病指南，诊疗覆盖多省市及周边国家，水平省内领先、接近国内先进。
4.解放军联勤保障部九二零医院 传染结核科解放军联勤保障部九二零医院传染结核科为成都军区传染病中心，人才梯队合理、科研实力雄厚，完成多项国家军队省市级科研课题，获全军及全国科技进步奖，发表百余篇学术论文。中西医结合治疗重型肝炎成功率达国内先进水平，多耐药结核与不明原因发热诊治省内领先，擅长各型肝炎、感染性腹泻、结核病等多种传染病诊疗，为军地传染病防治作出重要贡献，多次获表彰嘉奖。
5.云南省第一人民医院 感染性疾病科云南省第一人民医院感染性疾病科团队临床经验丰富，熟练掌握感染性疾病常见病、多发病及疑难病诊治，在病毒性肝炎、流行性感冒、麻疹、水痘带状疱疹、流行性腮腺炎、猩红热、结核病等常见感染性疾病诊疗方面具备显著优势，为患者提供规范可靠的诊疗服务。
