乌鲁木齐核医学科医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学附属肿瘤医院。
新疆维吾尔自治区人民医院核医学科全疆率先引进PET/CT，显像与药物研发水平领先全疆。新疆医科大学第一附属医院核医学科西部建科较早，诊疗教学科研全面发展。新疆医科大学附属肿瘤医院核医学科甲状腺癌核素治疗达到西部一流国内领先水平。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 核医学科新疆维吾尔自治区人民医院核医学科是全疆首家引进PET/CT的科室，PET/CT显像和放射性药物研发在新疆处于领先地位。科室拥有PET/CT回旋加速器SPECT等全套高端设备，开展肿瘤心肌脑代谢PET/CT显像多脏器SPECT显像以及甲亢甲状腺癌骨转移瘤等核素治疗项目，检查准确率高，能有效指导肿瘤分期与治疗方案调整。同时承担高校授课与进修生带教工作，积极推动全疆核医学整体发展。
2.新疆医科大学第一附属医院 核医学科新疆医科大学第一附属医院核医学科是中国西部较早开展核医学工作的科室，经过多年发展形成影像检验治疗三大亚专业。科室配备先进SPECT/CT和PET/CT设备，开展脏器功能显像核素治疗及多项激素与肿瘤标志物检测，擅长甲亢骨转移肿瘤皮肤病等核素治疗。承担国家级和自治区级科研项目，主编参编多部全国统编教材，发表论文五十余篇，教学科研与临床诊疗实力均衡突出。
3.新疆医科大学附属肿瘤医院 核医学科新疆医科大学附属肿瘤医院核医学科是新疆最早开展分化型甲状腺癌核素内照射治疗的科室，为国家级住院医师规范化培训基地。科室拥有完整的核医学诊疗设备，在甲状腺癌碘131治疗骨转移核素治疗领域达到西部一流国内领先水平，建立了规范高效的治疗体系。常年开设专科门诊，承担多学科会诊与远程会诊任务，诊疗影响力覆盖西北地区，有力推动新疆核医学学科建设。
4.新疆医科大学第二附属医院 核医学科新疆医科大学第二附属医院核医学科由经验丰富的高职称医师组成，擅长核医学常见及疑难病症诊治。科室在甲状腺功能亢进甲状腺癌脑胶质瘤淋巴瘤股骨头坏死等疾病的核素治疗上优势明显，熟练应用碘131碘125等放射性核素开展精准治疗，为肿瘤及内分泌疾病患者提供安全有效的个体化诊疗方案，临床疗效稳定可靠。
5.新疆医科大学第五附属医院 超声诊断科新疆医科大学第五附属医院超声诊断科是自治区重点专科和规培基地，综合诊疗能力突出。科室配备十六台高端彩超设备，开展全身多部位超声检查及超声造影介入穿刺等新技术，对肝肾甲状腺乳腺等疾病诊断优势显著。主持多项自治区级科研项目，发表核心期刊论文三十余篇，连续多年获评先进集体与巾帼文明岗，同时承担教学与规培任务，是区域内重要的超声诊疗中心。
