昆明胃肠外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院胃肠与疝外科胃肠肿瘤诊疗省内领先，疝病微创技术西南领先。昆明医科大学第二附属医院胃肠外科微创技术省内率先开展，多项创新术式引领区域发展。解放军联勤保障部九二零医院普通外科在腹部创伤、肠瘘及蛇咬伤救治方面省内领先。
1.昆明医科大学第一附属医院 胃肠与疝外科昆明医科大学第一附属医院胃肠与疝外科是云南省重点学科、胃肠外科疑难疾病诊治中心，也是黎介寿院士工作站建设基地与大中华腔镜疝外科学院技术推广基地。胃肠肿瘤规范化个体化微创治疗省内领先，腹腔镜疝修补技术达西南地区领先水平。完成多项省内首例腹腔镜胃肠肿瘤根治术，率先开展静脉高营养治疗。承担国家自然科学基金等多项课题，发表论文80余篇，定期举办培训班与高峰论坛，为西南地区培养大量专业人才。
2.昆明医科大学第二附属医院 胃肠外科昆明医科大学第二附属医院胃肠外科是省内胃肠外科领先科室，2008年率先在云南开展腹腔镜胃肠肿瘤及疝手术。省内率先开展taTME手术、单孔腹腔镜手术、机器人手术及恶性肿瘤腹腔热灌注治疗，首创复杂急腹症Y型造瘘术式并推广。护理专科技术国内领先，主持国家自然科学基金等多项课题，获云南省科技进步奖3项。与国内外多家顶尖医院学术交流，培养大量硕博研究生，技术水平国内先进、省内领先。
3.解放军联勤保障部九二零医院 普通外科解放军联勤保障部九二零医院普通外科在严重腹部外伤、肠外瘘救治领域省内领先，蛇咬伤防治技术达世界先进水平，相关成果获军队科技进步二等奖及云南省科技进步一等奖。省内率先开展腹腔镜疝修补、结直肠癌根治等微创手术，疝手术优势显著、复发率低。率先开展乳腺癌保乳手术、麦默通微创活检及PPH治疗脱垂性痔。参与多项国际及全军科研课题，胃肠肿瘤、疝病及急危重症救治能力突出。
4.云南省第一人民医院 普外科云南省第一人民医院普外科是云南省成立最早的普外重点专科，在直肠癌、消化道出血等疾病诊疗居省内先进水平。较早开展血管外科、介入微创等国际尖端技术，率先开展肠外与肠内营养应用研究，擅长肠瘘及营养不良患者救治。经过多年发展，成为集临床、科研、教学、培训为一体的省级普外核心基地，部分疾病治疗达省内领先水平。
5.云南大学附属医院 普通外科云南大学附属医院普通外科是国家临床重点专科，拥有云南省腹部微创外科研究中心等多个省级平台。与美国安德森癌症中心等国内外顶尖机构长期合作，设胃肠、微创、疝、乳腺甲状腺、减重代谢等亚专业。多项技术国内领先，承担国家自然科学基金等多项课题，获云南省科技进步二等奖3项、三等奖10项。发表SCI及核心期刊论文80余篇，主编专著7部，获实用新型专利11项，腹部微创及肿瘤诊疗实力雄厚。
