脑干损伤后会有多种后遗症，包括意识障碍相关的长期昏迷、意识障碍程度改变，运动功能相关的肢体瘫痪、运动协调障碍，颅神经功能相关的眼球运动障碍、面部感觉和运动障碍，呼吸循环功能相关的呼吸和循环功能异常，以及认知功能障碍、二便功能障碍等。
一、意识障碍相关后遗症
1.长期昏迷
脑干是维持意识的重要结构，脑干损伤后可能导致患者长期处于昏迷状态。例如，严重的脑干损伤患者，由于脑干网状结构受损，影响了上行性网状激活系统，使得大脑皮质不能维持觉醒状态。在儿童中，脑干损伤引起的长期昏迷可能会影响其神经心理发育，因为正常的意识状态是儿童学习、认知等神经心理活动的基础。对于成人，长期昏迷会导致生活不能自理，需要长期的护理，这对患者的家庭和社会都带来沉重负担。
2.意识障碍程度改变的后遗症
患者可能从昏迷状态转为植物状态，植物状态是一种特殊的意识障碍状态，患者有睡眠-觉醒周期，但无自我意识和环境意识。在儿童中，植物状态可能会影响其身体的正常生长发育，因为植物状态下患者不能正常进食、活动等，导致营养摄入不足、肌肉萎缩等问题。成人植物状态患者同样面临诸多健康问题，如肺部感染、压疮等并发症的风险增加。
二、运动功能相关后遗症
1.肢体瘫痪
脑干内有支配肢体运动的神经传导束经过，脑干损伤可能导致肢体瘫痪。例如，皮质脊髓束受损会引起肢体的上运动神经元性瘫痪。在儿童中，脑干损伤导致的肢体瘫痪会影响其运动发育，可能出现肌肉萎缩、关节挛缩等问题。对于成人，肢体瘫痪会严重影响其日常生活活动能力，如不能自行穿衣、进食等，还可能引发废用性骨质疏松等问题。
2.运动协调障碍
脑干中的前庭神经核等结构与运动协调有关，脑干损伤后患者可能出现运动协调障碍，表现为平衡失调、步态不稳等。儿童脑干损伤后运动协调障碍会影响其正常的行走、跑跳等运动能力发展，而成人则会影响其日常的行走安全，增加跌倒的风险。
三、颅神经功能相关后遗症
1.眼球运动障碍
脑干内有动眼神经、滑车神经、外展神经等颅神经核团及神经纤维走行，脑干损伤可导致眼球运动障碍，如眼球不能正常转动、复视等。在儿童中，眼球运动障碍可能会影响其视觉发育和认知发展，因为正常的眼球运动是视觉感知和认知的重要基础。成人眼球运动障碍会影响其日常的视觉功能，如阅读、驾驶等活动都会受到严重影响。
2.面部感觉和运动障碍
三叉神经等颅神经相关结构受损会导致面部感觉和运动障碍，如面部感觉减退、咀嚼肌无力等。儿童面部感觉和运动障碍可能会影响其面部表情的正常发育，进而影响社交互动等方面。成人面部感觉和运动障碍会影响其面部的正常功能，如进食时咀嚼困难等问题。
四、呼吸、循环功能相关后遗症
1.呼吸功能异常后遗症
脑干是呼吸中枢所在部位，脑干损伤后可能出现呼吸节律异常，如潮式呼吸、呼吸暂停等。在儿童中，呼吸功能异常会严重影响其生命体征的稳定，因为儿童的呼吸调节功能相对较弱。成人呼吸功能异常同样会危及生命，并且长期的呼吸功能异常还可能导致肺部感染等并发症的反复发生。
2.循环功能异常后遗症
脑干损伤可能影响心血管中枢，导致血压、心率等循环功能异常。例如，可能出现血压不稳定、心率失常等情况。儿童脑干损伤后循环功能异常会影响其全身的血液供应，进而影响各器官的正常发育和功能。成人循环功能异常会影响重要器官的血液灌注，如脑、心等器官的供血不足可能会导致更严重的神经功能缺损等问题。
五、其他后遗症
1.认知功能障碍
脑干与大脑皮质之间有神经纤维联系，脑干损伤可能影响认知功能，如注意力不集中、记忆力减退、思维能力下降等。儿童脑干损伤后认知功能障碍会严重影响其学习和智力发育，而成人认知功能障碍会影响其工作和生活能力。
2.二便功能障碍
脑干损伤可能影响自主神经功能，导致二便功能障碍，如尿失禁、便秘等。儿童二便功能障碍会影响其生活质量和身体卫生状况，成人二便功能障碍也会给生活带来极大不便，并且容易引发泌尿系统感染等并发症。
