内分泌失调可由下丘脑-垂体功能异常、甲状腺功能异常、卵巢功能异常、生活方式因素、慢性疾病、药物影响等引起，下丘脑-垂体轴功能紊乱会使促性腺激素比例失调影响排卵致月经周期延长，甲状腺功能减退或亢进会干扰生殖内分泌致月经周期改变，多囊卵巢综合征致卵巢多囊样改变、雄激素高和排卵障碍使月经周期延长，卵巢早衰因卵巢功能减退致月经周期延长，过度节食致雌激素合成减少干扰月经周期，长期熬夜打乱内分泌节律致月经周期延长，慢性疾病如贫血、结核病、糖尿病等干扰生殖内分泌致月经周期长，某些药物如避孕药、抗精神病药、抗肿瘤药等干扰内分泌平衡致月经周期改变。
下丘脑-垂体功能异常：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）调节垂体促性腺激素的分泌，进而影响卵巢功能。若下丘脑-垂体轴功能紊乱，如因精神压力大、过度节食等导致GnRH分泌异常，可使垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）比例失调，影响卵泡的正常发育和排卵，从而导致月经周期延长。例如，长期处于高压力状态的女性，下丘脑分泌GnRH受抑制，就可能出现月经周期延长的情况。
甲状腺功能异常：甲状腺激素对女性生殖系统有重要影响。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，机体代谢率降低，会影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致月经周期延长，常伴有经量减少，严重者可出现闭经；而甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，也可能干扰生殖内分泌，引起月经周期改变，如月经周期延长、经量减少等。有研究表明，甲状腺功能异常的女性中，约一定比例会出现月经周期长的现象。
卵巢功能异常
多囊卵巢综合征（PCOS）：这是一种常见的妇科内分泌疾病，主要特征是卵巢多囊样改变、雄激素水平升高和排卵障碍。患者卵巢内有多个小卵泡，但难以发育成熟并排卵，导致月经周期延长，甚至数月不来月经。PCOS的发病与遗传因素和环境因素共同作用有关，肥胖、胰岛素抵抗等也会加重病情，影响月经周期。据统计，PCOS患者中月经周期长的发生率较高。
卵巢早衰：女性在40岁以前卵巢功能减退称为卵巢早衰。卵巢功能衰退，雌激素分泌减少，卵泡发育障碍，会出现月经周期延长、经量减少，最终可能闭经。自身免疫性疾病、遗传因素、医源性因素（如放疗、化疗）等都可能导致卵巢早衰。例如，自身免疫性甲状腺炎患者常合并卵巢早衰，出现月经周期长的情况。
其他因素
生活方式因素
过度节食：女性过度节食，机体摄入热量不足，会影响体内脂肪的含量，而脂肪是合成雌激素的原料之一。当体内脂肪过少时，雌激素合成减少，就会干扰月经周期，导致月经周期延长。比如，一些追求身材苗条的女性，长期过度节食，容易出现月经不调，包括月经周期长。
长期熬夜：长期熬夜会影响内分泌系统的正常节律。人体的内分泌激素分泌有其自身的昼夜节律，熬夜会打乱这种节律，影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，从而导致月经周期延长。经常熬夜的女性，月经周期可能会出现紊乱情况。
慢性疾病：一些慢性疾病也可能影响月经周期，如严重的贫血、结核病、糖尿病等。贫血会导致机体氧气供应不足，影响身体的正常代谢和内分泌功能；结核病等慢性消耗性疾病会使身体处于虚弱状态，干扰生殖内分泌，从而引起月经周期长。例如，患有重度贫血的女性，月经周期往往会延长，经量也可能增多或减少。
药物影响：某些药物也可能导致月经周期延长。例如，长期服用避孕药，其中的激素成分可能会干扰体内的内分泌平衡，导致月经周期改变；抗精神病药物、某些抗肿瘤药物等也可能对月经周期产生影响。不同药物对月经周期的影响机制不同，如避孕药主要是通过抑制排卵等环节影响月经。
