阴茎萎缩变小可由多种因素引起，年龄方面儿童期因内分泌发育异常、老年期因雄激素水平下降可致；疾病方面内分泌疾病如性腺功能减退症、甲状腺疾病，阴茎本身疾病如外伤、感染可引发；生活方式中吸烟、酗酒、缺乏运动有影响；还有药物因素及心理因素也会导致阴茎萎缩变小。
一、年龄因素
（一）儿童期
儿童期阴茎萎缩变小可能与内分泌发育异常有关。例如，下丘脑-垂体-性腺轴功能尚未完全成熟，若出现促性腺激素分泌不足等情况，会影响雄激素的分泌，而雄激素对阴茎的正常发育至关重要。一般来说，此阶段若有先天性垂体疾病等，可能导致激素分泌异常，进而影响阴茎发育，出现萎缩变小的情况。
（二）老年期
随着年龄增长，男性体内雄激素水平逐渐下降，这是导致老年男性阴茎萎缩变小的常见原因之一。正常男性到了老年，睾丸功能衰退，雄激素分泌量减少，会引起阴茎海绵体萎缩等变化，使得阴茎在外观和尺寸上出现变小的情况，这是一种生理上的退行性改变。
二、疾病因素
（一）内分泌疾病
1.性腺功能减退症：包括原发性性腺功能减退和继发性性腺功能减退。原发性性腺功能减退如克莱恩费尔特综合征，患者染色体核型多为47，XXY，睾丸生精功能障碍，同时雄激素分泌减少，可导致阴茎萎缩变小。继发性性腺功能减退多由下丘脑或垂体病变引起，例如垂体瘤可影响促性腺激素的分泌，进而影响睾丸雄激素的产生，致使阴茎发育受影响出现萎缩。
2.甲状腺疾病：甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响机体的代谢以及内分泌功能平衡，可能间接影响雄激素的代谢等，从而导致阴茎出现萎缩变小的情况；而甲状腺功能亢进时，过度的代谢状态也可能对生殖内分泌产生不良影响，导致阴茎相关异常。
（二）阴茎本身的疾病
1.阴茎外伤：严重的阴茎外伤，如车祸伤、暴力打击等导致阴茎白膜破裂、海绵体损伤等，若后期修复不良，可能会引起阴茎海绵体纤维化等，影响阴茎的正常结构和功能，导致阴茎萎缩变小。例如，阴茎外伤后没有得到及时正确的治疗，局部组织瘢痕形成，限制了阴茎的正常勃起和伸展，进而出现萎缩。
2.阴茎感染性疾病：长期慢性的阴茎感染，如反复的阴茎头炎、尿道炎等，炎症刺激可能导致阴茎组织的破坏和纤维化。例如，梅毒螺旋体感染引起的阴茎梅毒，如果没有得到有效控制，病情进展可能会损害阴茎的组织结构，导致阴茎萎缩变小。
三、生活方式因素
（一）吸烟
长期大量吸烟会影响血管的功能，导致阴茎海绵体的血管收缩和舒张功能障碍。香烟中的尼古丁等有害物质会使血管内皮细胞受损，影响阴茎海绵体血供，长期下来可能影响阴茎的正常发育和维持，导致阴茎萎缩变小。研究表明，吸烟男性发生阴茎血管性疾病的风险明显高于不吸烟男性，进而增加了阴茎萎缩的可能性。
（二）酗酒
过度酗酒会损害肝脏等器官的功能，影响激素的代谢。酒精会干扰肝脏对雄激素的代谢过程，导致雄激素水平异常。同时，酒精还可能对生殖系统产生直接的毒性作用，影响睾丸的生精功能和雄激素分泌，从而引起阴茎萎缩变小。长期酗酒的男性，其体内雄激素水平往往低于正常水平，这与阴茎萎缩的发生密切相关。
（三）缺乏运动
长期缺乏运动的人，身体代谢率降低，脂肪容易堆积。肥胖可能导致体内内分泌紊乱，影响雄激素的分泌和作用。例如，肥胖男性中胰岛素抵抗较为常见，胰岛素抵抗会影响雄激素的合成和代谢，进而对阴茎的发育和维持产生不利影响，增加阴茎萎缩变小的风险。
四、其他因素
（一）药物因素
某些药物的长期使用可能导致阴茎萎缩变小。例如，长期使用一些抗肿瘤药物，可能会对生殖系统产生毒性作用，影响睾丸功能和雄激素分泌；抗高血压药物中的某些类型，如部分β受体阻滞剂等，可能通过影响血管功能或内分泌等途径，间接导致阴茎血流减少或激素水平变化，引起阴茎萎缩。
（二）心理因素
长期的心理压力过大、焦虑、抑郁等不良心理状态，可能通过神经-内分泌系统影响生殖内分泌功能。例如，长期的精神紧张会导致下丘脑-垂体-性腺轴功能紊乱，引起雄激素分泌减少，进而影响阴茎的正常状态，出现萎缩变小的情况。尤其是对于一些年轻男性，长期的心理应激可能对生殖系统发育和维持产生不良影响。
