子宫内膜薄的原因包括内分泌因素（雌激素水平低下、孕激素分泌异常）、子宫内膜损伤（人工流产手术、宫腔操作史）、子宫病变（子宫畸形、子宫内膜炎）及其他因素（年龄因素、生活方式因素）。雌激素水平低下使子宫内膜腺体及间质增生不足，孕激素分泌异常影响子宫内膜转化；多次人工流产、宫腔操作易损伤子宫内膜；子宫畸形致宫腔形态异常、子宫内膜炎持续刺激影响其生长；年龄增长致卵巢功能衰退、再生能力下降，长期吸烟、过度节食等不良生活方式也会影响子宫内膜状态。
一、内分泌因素
（一）雌激素水平低下
雌激素对子宫内膜的生长起着关键作用，它能促进子宫内膜增殖。女性体内雌激素水平低下可能由多种原因导致，例如多囊卵巢综合征患者，其内分泌轴紊乱，会影响雌激素的正常分泌；围绝经期女性，卵巢功能逐渐衰退，雌激素分泌减少，都可能致使子宫内膜薄。有研究表明，雌激素水平降低会使子宫内膜腺体及间质增生不足，从而造成子宫内膜厚度低于正常范围。
（二）孕激素分泌异常
孕激素需要在雌激素作用的基础上发挥作用，协同雌激素使子宫内膜从增殖期转变为分泌期。若孕激素分泌不足或作用异常，会影响子宫内膜的转化，导致子宫内膜薄。比如一些黄体功能不全的患者，黄体分泌的孕激素量不够，就会出现子宫内膜薄的情况。
二、子宫内膜损伤
（一）人工流产手术
多次人工流产是导致子宫内膜损伤的常见原因之一。人工流产时，手术器械会刮擦子宫内膜，可能造成基底层损伤，基底层受损后会影响子宫内膜的再生和修复，进而使子宫内膜变薄。有统计显示，多次人工流产史的女性发生子宫内膜薄的几率明显高于无人工流产史的女性。不同年龄的女性在人工流产后发生子宫内膜损伤的风险有所不同，一般来说，育龄期女性尤其是反复进行人工流产的育龄女性，风险相对更高。
（二）宫腔操作史
除了人工流产，其他宫腔操作，如诊断性刮宫、子宫肌瘤剔除术等，也可能损伤子宫内膜。例如诊断性刮宫，在刮取子宫内膜组织进行病理检查时，可能会对子宫内膜造成一定程度的损伤，影响其正常生长，导致子宫内膜薄。对于有宫腔操作史的女性，尤其是年龄较轻、频繁进行宫腔操作的女性，更要关注子宫内膜的情况。
三、子宫病变
（一）子宫畸形
先天性子宫畸形，如双角子宫、纵隔子宫等，可能影响子宫内膜的正常生长环境。子宫畸形会导致宫腔形态异常，使得子宫内膜的种植和生长受到限制，从而出现子宫内膜薄的情况。不同类型的子宫畸形对子宫内膜的影响程度有所差异，纵隔子宫患者往往更容易出现子宫内膜薄的问题，而且这种情况在青春期女性中也可能存在。
（二）子宫内膜炎
慢性子宫内膜炎会持续刺激子宫内膜，影响其正常的增殖和修复。炎症会导致子宫内膜出现充血、水肿等病理改变，长期的炎症状态会使子宫内膜变薄。各个年龄段的女性都可能患上子宫内膜炎，但育龄期女性相对更易发生，若不及时治疗，可能会对子宫内膜造成长期损害。
四、其他因素
（一）年龄因素
随着年龄的增长，女性的卵巢功能逐渐衰退，雌激素分泌减少，同时子宫内膜本身的再生能力也会下降，这使得年龄较大的女性更容易出现子宫内膜薄的情况。一般来说，35岁以上的女性子宫内膜薄的发生率会有所增加，而40岁以上的女性子宫内膜薄的问题可能更为突出。
（二）生活方式因素
长期不健康的生活方式也可能影响子宫内膜的状态。例如长期吸烟的女性，烟草中的有害物质会影响血管收缩，减少子宫内膜的血液供应，进而影响子宫内膜的生长；过度节食导致营养不良的女性，由于身体缺乏必要的营养物质，也会影响雌激素等内分泌激素的合成，从而造成子宫内膜薄。不同生活方式的女性受到的影响程度不同，长期吸烟的女性以及长期节食减肥的女性风险相对较高。
