不孕的原因包括女性因素、男性因素及男女双方共同因素。女性因素有排卵障碍、输卵管因素、子宫因素、宫颈因素、免疫因素；男性因素有精液异常、生精功能障碍、免疫因素、性功能障碍；男女双方共同因素有免疫因素、不明原因不孕，不明原因不孕约占10%-15%。
输卵管因素：输卵管堵塞或粘连是女性不孕症的常见原因之一。输卵管炎症是导致输卵管梗阻的主要原因，盆腔炎性疾病可由性传播疾病如淋病奈瑟菌、衣原体感染引起，也可由需氧菌、厌氧菌混合感染所致，盆腔炎性疾病反复发作可引起输卵管粘连、堵塞，据研究，盆腔炎性疾病患者中约有20%-30%会出现输卵管因素导致的不孕。子宫内膜异位症可累及输卵管，异位的子宫内膜组织可导致输卵管周围粘连，影响输卵管的拾卵和运输功能，子宫内膜异位症患者中不孕的发生率较高，约为30%-50%。
子宫因素：子宫畸形可影响受孕，如纵隔子宫、双角子宫等，子宫畸形会影响胚胎的着床和发育。子宫肌瘤也可能导致不孕，黏膜下子宫肌瘤可影响宫腔形态，妨碍受精卵着床；肌壁间子宫肌瘤过大时可压迫输卵管间质部，影响输卵管通畅性，黏膜下子宫肌瘤患者不孕发生率约为25%-40%，肌壁间子宫肌瘤直径＞5cm时可能对妊娠产生不利影响。子宫内膜病变，如子宫内膜炎、子宫内膜息肉等，子宫内膜炎可影响子宫内膜容受性，子宫内膜息肉可干扰胚胎着床，子宫内膜炎患者中约有10%-15%会出现不孕情况，直径＞1cm的子宫内膜息肉可能降低妊娠率。
宫颈因素：宫颈狭窄或宫颈粘连可影响精子通过，先天性宫颈狭窄较少见，多因宫颈损伤（如宫颈锥形切除术后）引起宫颈粘连，宫颈粘连会阻碍精子进入宫腔，从而导致不孕。宫颈病变，如宫颈息肉、宫颈炎等，宫颈息肉可能阻塞宫颈管，影响精子通行；宫颈炎时宫颈黏液性状改变，不利于精子穿透，宫颈息肉患者不孕发生率相对较低，但也有一定影响，宫颈炎患者中约有5%-10%可能因宫颈黏液异常导致不孕。
免疫因素：女性体内存在抗精子抗体、抗子宫内膜抗体等免疫抗体时可能导致不孕。抗精子抗体可阻碍精子穿过宫颈黏液，影响精子与卵子结合；抗子宫内膜抗体可能干扰胚胎着床，据报道，不明原因不孕患者中约有10%-15%存在抗子宫内膜抗体阳性情况。
男性因素
精液异常：少精子症是指精液中精子密度低于正常范围，正常精子密度应≥15×10/mL，少精子症的病因包括精索静脉曲张、隐睾、内分泌失调、染色体异常等，精索静脉曲张可影响睾丸的生精功能，据统计，精索静脉曲张患者中约有40%-60%存在精液异常，其中少精子症较为常见。无精子症分为梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症，梗阻性无精子症可由附睾、输精管等部位的梗阻引起，如先天性输精管缺如、附睾炎后梗阻等；非梗阻性无精子症多与睾丸生精功能障碍有关，如克氏综合征（47,XXY）等染色体异常疾病可导致睾丸生精障碍。弱精子症是指精子活力低下，精子向前运动的能力减弱，影响精子与卵子结合，引起弱精子症的原因有精索静脉曲张、感染、精液液化异常等，精索静脉曲张可通过影响睾丸局部温度、氧自由基水平等导致精子活力下降，弱精子症患者中约有30%-50%与精索静脉曲张有关。畸形精子症是指精液中畸形精子所占比例过高，畸形精子过多会影响精子的受精能力，导致不孕，引起畸形精子症的原因包括生殖系统感染、内分泌异常、接触放射性物质或化学毒物等。
生精功能障碍：睾丸本身的病变可导致生精功能障碍，如睾丸炎，流行性腮腺炎合并睾丸炎是常见的导致睾丸生精功能障碍的原因，青春期后患流行性腮腺炎的患者中约有20%会并发睾丸炎，从而影响生育能力；睾丸外伤、睾丸扭转等也可损伤睾丸组织，影响生精功能。内分泌紊乱可影响睾丸的生精功能，下丘脑-垂体-睾丸轴的任何一个环节出现问题都可能导致生精功能异常，如垂体瘤可导致促性腺激素分泌异常，进而影响睾丸生精。
免疫因素：男性体内产生抗精子抗体可导致免疫性不育，抗精子抗体可抑制精子的活动力、阻碍精子穿过宫颈黏液等，据研究，男性不育患者中约有10%-15%存在抗精子抗体阳性情况。
性功能障碍：勃起功能障碍可导致精子无法进入阴道，影响受孕；早泄也可能影响正常的性生活和精子进入阴道的过程，勃起功能障碍的病因包括心理因素、血管性因素、神经性因素等，心理因素如焦虑、抑郁等可通过影响神经内分泌功能导致勃起功能障碍，血管性因素如动脉粥样硬化可导致阴茎海绵体血流不足，引起勃起功能障碍。
男女双方共同因素
免疫因素：除了男女双方自身产生的免疫抗体外，夫妻双方之间的免疫不适应也可能导致不孕，如女性对男性精子产生免疫排斥反应，这种情况相对少见，但也有报道，约占不孕夫妇的1%-3%。
不明原因不孕：约有10%-15%的不孕夫妇经过详细检查后仍找不到明确的病因，称为不明原因不孕，其发病机制可能涉及免疫因素、潜在的卵母细胞质量问题、输卵管微环境异常等多种尚未明确的因素。
