子宫内膜薄的原因包括内分泌失调（雌激素水平低下、孕激素不足）、子宫内膜损伤（人工流产手术、宫腔手术操作）、子宫发育畸形（先天性子宫发育不良）以及其他因素（年龄因素、生活方式因素）。内分泌失调中雌激素水平低下与多囊卵巢综合征、下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常等有关，孕激素不足与黄体功能不全相关；子宫内膜损伤中多次人工流产、宫腔手术操作会直接或间接损伤子宫内膜；先天性子宫发育不良会致子宫体积小、内膜面积小；年龄增长使卵巢功能衰退、雌激素分泌减少致内膜增殖能力下降；长期熬夜、过度减肥等不良生活方式影响内分泌及雌激素合成，进而影响内膜厚度。
一、内分泌失调
1.雌激素水平低下
雌激素对子宫内膜的生长起着关键作用。在女性的月经周期中，雌激素会促使子宫内膜增厚。如果体内雌激素分泌不足，例如多囊卵巢综合征患者，由于内分泌紊乱，卵巢功能异常，导致雌激素分泌减少，就会使子宫内膜无法正常增厚。临床研究发现，多囊卵巢综合征患者中子宫内膜薄的发生率相对较高，这是因为其内分泌轴的失衡影响了雌激素的正常分泌及对子宫内膜的作用。
下丘脑-垂体-卵巢轴的功能异常也可能导致雌激素水平低下。比如长期精神压力过大、过度节食等情况，会影响下丘脑分泌促性腺激素释放激素，进而影响垂体分泌促性腺激素，最终导致卵巢分泌雌激素减少，引起子宫内膜薄。
2.孕激素不足
孕激素在月经周期的后半期发挥作用，它可以使增殖期的子宫内膜转化为分泌期内膜，为受精卵着床做准备。如果孕激素分泌不足，子宫内膜就不能很好地从增殖期向分泌期转化，从而出现子宫内膜薄的情况。例如一些有黄体功能不全的女性，黄体期孕激素分泌量不足，就会影响子宫内膜的正常生长和转化，导致子宫内膜薄。
二、子宫内膜损伤
1.人工流产手术
多次人工流产是导致子宫内膜薄的常见原因之一。人工流产时，手术器械会对子宫内膜造成直接的损伤。反复的人工流产会使子宫内膜基底层受损，基底层是子宫内膜再生的重要部分，基底层受损后，子宫内膜的修复能力下降，导致子宫内膜变薄。有研究统计，多次人工流产史的女性中子宫内膜薄的比例明显高于无人工流产史的女性。
人工流产术后感染也会加重子宫内膜的损伤。术后如果发生宫腔感染，炎症会进一步破坏子宫内膜组织，影响子宫内膜的正常生长，导致子宫内膜薄。
2.宫腔手术操作
除了人工流产，其他宫腔手术如子宫肌瘤剔除术、宫腔粘连分离术等也可能损伤子宫内膜。例如子宫肌瘤剔除术时，手术过程中对子宫肌层和内膜的操作可能会破坏子宫内膜的结构，影响其正常的生长和修复，导致术后子宫内膜薄。宫腔粘连分离术后，由于宫腔粘连被分离，但是子宫内膜的修复需要一定时间，而且如果在分离过程中对子宫内膜造成了较大损伤，也容易出现子宫内膜薄的情况。
三、子宫发育畸形
1.先天性子宫发育不良
有些女性先天性子宫发育不良，子宫体积较小，子宫内膜的面积也相对较小，从而表现为子宫内膜薄。先天性子宫发育不良是由于胚胎时期子宫发育异常所致，这种情况在临床上相对较少见，但也是导致子宫内膜薄的一个原因。通过超声等检查可以发现子宫的形态和大小异常，进而判断是否存在先天性子宫发育不良导致的子宫内膜薄。
这类患者除了子宫内膜薄外，可能还伴有月经异常等情况，如月经量过少等，这与子宫发育不良导致的整体生殖系统功能异常有关。
四、其他因素
1.年龄因素
随着年龄的增长，女性的卵巢功能会逐渐衰退，雌激素分泌减少，子宫内膜的增殖能力也会下降。一般来说，35岁以上的女性子宫内膜薄的发生率会有所增加。因为随着年龄增加，卵巢内卵泡的数量和质量都在下降，内分泌功能发生变化，影响了子宫内膜的正常生长。例如，老年女性绝经后，卵巢功能衰退，雌激素水平极低，子宫内膜会处于很薄的状态，这是生理性的子宫内膜薄，但对于育龄期女性，年龄过大也会影响子宫内膜的厚度。
2.生活方式因素
长期熬夜、过度减肥等不良生活方式也可能影响子宫内膜厚度。长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常功能，进而影响雌激素的分泌和子宫内膜的生长。过度减肥的女性，由于身体脂肪含量过低，会影响雌激素的合成，因为雌激素是一种类固醇激素，需要脂肪组织中的前体物质来合成，所以过度减肥会导致雌激素水平下降，引起子宫内膜薄。
