系统性红斑狼疮可累及多系统多器官，出现多种症状。皮肤黏膜有蝶形红斑、盘状红斑、光过敏、黏膜损害等；全身有发热、疲劳、体重下降等；关节肌肉有关节疼痛、肿胀、肌无力、肌痛等；肾脏有蛋白尿、血尿、水肿、高血压甚至肾功能衰竭等；血液系统有贫血、白细胞减少、血小板减少等；神经系统有头痛、精神症状、癫痫发作、认知障碍等；心血管系统有心包炎、心肌炎、血管炎及雷诺现象等。
全身症状
多数患者会有全身症状，如发热，可为低热、中度热甚至高热，发热原因与疾病本身的炎症反应以及免疫调节异常有关。疲劳也是常见症状，患者常感全身乏力、疲倦，严重影响日常生活和工作，这可能与疾病导致的机体代谢紊乱、能量消耗增加以及自身免疫攻击等多种因素相关，不同年龄、性别患者均可能出现疲劳感，且生活方式不健康、有基础病史的患者可能疲劳感更明显。体重下降也较为常见，由于疾病导致食欲减退、机体代谢异常等原因，患者体重逐渐减轻。
关节肌肉症状
关节肌肉症状是系统性红斑狼疮常见表现之一。约90%以上患者会出现关节疼痛，可累及多个关节，如手指关节、腕关节、膝关节等，多为对称性，疼痛性质多样，可为隐痛、胀痛等。部分患者有关节肿胀，但一般无严重的骨质破坏，关节X线检查多无明显异常，这与类风湿关节炎等疾病不同，其关节疼痛机制主要与关节周围组织的炎症、滑膜炎症等有关。肌肉症状方面，患者可出现肌无力，表现为上下楼梯困难、持物费力等，部分患者有肌痛，实验室检查可能发现血清肌酶升高，如肌酸激酶等，这是因为肌肉组织受到自身免疫相关的损伤。
肾脏症状
肾脏是系统性红斑狼疮常累及的重要脏器，约50%-70%的患者在病程中会出现肾脏受累。临床表现多样，轻者可仅有尿常规异常，如蛋白尿、血尿等，重者可出现大量蛋白尿、水肿、高血压，甚至肾功能衰竭。肾脏受累的病理基础是免疫复合物在肾小球沉积，引发肾脏的炎症反应，不同年龄患者肾脏受累表现可能有所差异，儿童患者肾脏受累相对更易出现急性肾功能不全等严重情况，女性患者由于生理特点等因素肾脏受累的发病及病情进展可能有其特点，有基础肾脏病史的患者出现系统性红斑狼疮时肾脏受累情况可能更为复杂。
血液系统症状
血液系统常受累及，表现为贫血，可为正细胞正色素性贫血，也可因红细胞破坏增加等原因导致贫血，发生率较高。白细胞减少较为常见，患者外周血白细胞计数低于正常范围，这与自身抗体导致的白细胞破坏增加以及骨髓造血受抑制等因素有关。血小板减少也不少见，可导致皮肤黏膜出血点、瘀斑等，严重时可出现内脏出血等情况，血液系统症状的出现与自身免疫介导的血细胞破坏等免疫异常机制相关，不同年龄、性别患者血液系统受累的表现及严重程度可能因个体差异而不同。
神经系统症状
神经系统受累较为复杂，可表现为头痛，是常见的神经系统症状之一，部分患者头痛较为剧烈。还可出现精神症状，如抑郁、焦虑、失眠等，也有患者出现癫痫发作，这是因为中枢神经系统受累，自身抗体攻击神经组织，导致神经功能紊乱。另外，可出现认知障碍，表现为记忆力减退、注意力不集中等，儿童患者神经系统受累时可能影响其智力发育和学习能力，女性患者在生理期等特殊时期神经系统症状可能会有变化，有神经系统基础病史的患者出现系统性红斑狼疮时神经系统症状可能更易加重或出现特殊表现。
心血管系统症状
心血管系统也可受累，患者可出现心包炎，表现为胸痛、心包摩擦音等，心电图检查可能发现异常。还可出现心肌炎，导致心悸、胸闷等症状，严重时可影响心脏功能。此外，血管炎也较为常见，可累及中小血管，引起雷诺现象，表现为手指或足趾遇冷后出现变白、变紫、变红的典型变化，这与血管痉挛及血管内皮损伤等因素有关，不同年龄患者心血管系统受累的表现和预后可能不同，男性患者心血管受累的风险及病情特点可能有其特殊性，有心血管基础病史的患者出现系统性红斑狼疮时心血管系统症状可能更为复杂和严重。
