习惯性流产的发生与遗传、解剖、内分泌、免疫、感染、生活方式及全身性疾病等多种因素相关。遗传因素包括夫妻染色体异常及年龄影响；解剖因素有子宫畸形、宫腔粘连等；内分泌因素涉及黄体功能不全、甲状腺功能异常；免疫因素包含自身免疫性疾病及同种免疫异常；感染因素是某些病原体感染致子宫内环境炎症；生活方式方面不良习惯及精神心理因素有影响；全身性疾病如未控糖尿病、高血压也会增加风险。
解剖因素
子宫解剖结构异常：
子宫畸形：如纵隔子宫、单角子宫等。纵隔子宫是由于胚胎发育时期纵隔吸收不全所致，纵隔会影响胚胎着床和发育空间，导致胚胎种植后因空间不足等原因发生流产。单角子宫则是子宫发育过程中一侧副中肾管发育正常，另一侧发育不全，子宫腔较小，不利于胚胎生长发育。对于有子宫畸形的患者，尤其是有习惯性流产史的，需要通过手术等方式矫正子宫结构，以改善妊娠结局。
宫腔粘连：多因宫腔操作史（如人工流产、刮宫等）导致子宫内膜损伤，引起宫腔部分或全部粘连。宫腔粘连会使宫腔容积减小，影响胚胎着床和营养供应，从而增加习惯性流产的发生风险。有宫腔操作病史的女性，若出现习惯性流产，需考虑宫腔粘连的可能，可通过宫腔镜检查明确诊断并进行相应治疗。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕酮分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，导致胚胎发育受阻而流产。女性内分泌失调、垂体-下丘脑-卵巢轴功能紊乱等都可能引起黄体功能不全。从年龄角度，育龄后期女性黄体功能相对较弱，更容易出现黄体功能不全相关的习惯性流产。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进均可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会干扰胚胎的正常发育过程；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会对妊娠产生不良影响，增加流产风险。甲状腺功能异常的发生与自身免疫、遗传等多种因素相关，患有甲状腺疾病的女性在计划妊娠前需将甲状腺功能调整至正常范围，以降低习惯性流产的发生几率。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病患者，体内存在自身抗体，这些抗体可通过多种途径影响胚胎发育，导致习惯性流产。自身免疫性疾病的发生与遗传易感性、环境因素等有关，患有自身免疫性疾病的女性在妊娠前需在风湿免疫科等多学科协作下进行评估和管理，控制病情稳定后再考虑妊娠。
同种免疫异常：孕妇对胚胎的免疫耐受异常，母体免疫系统将胚胎视为“异物”进行攻击，导致流产。例如，母胎界面自然杀伤细胞功能异常等情况可能引发同种免疫异常。这种免疫异常的发生机制较为复杂，涉及多种免疫细胞和细胞因子的失衡，对于有同种免疫异常导致习惯性流产的患者，可能需要进行免疫治疗等干预措施。
感染因素
病原体感染：某些病原体感染可引起子宫内环境炎症，影响胚胎着床和发育。例如，支原体、衣原体、弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒等感染。女性在妊娠前或妊娠早期感染这些病原体，可能导致习惯性流产。不同病原体的感染途径不同，如弓形虫可通过接触受感染的猫粪、食用未煮熟的肉类等感染；风疹病毒主要通过呼吸道传播等。有感染史或生活在感染高风险环境中的女性，在计划妊娠时需进行相关病原体的筛查，如有感染需及时治疗后再受孕。
其他因素
生活方式因素：长期吸烟、酗酒、过度咖啡因摄入等不良生活方式可增加习惯性流产的风险。吸烟会导致血管收缩，影响子宫胎盘血流灌注；酗酒可损害胚胎发育；过度咖啡因摄入可能干扰内分泌等。另外，过度紧张、焦虑等精神心理因素也可能通过神经内分泌系统影响妊娠，增加习惯性流产的发生几率。
全身性疾病：如糖尿病、高血压等全身性疾病未得到良好控制时，也可能影响胎盘功能和胚胎发育，导致习惯性流产。糖尿病患者血糖控制不佳时，高血糖环境不利于胚胎生长；高血压患者血压升高可导致胎盘血管痉挛，影响胎盘供血，从而增加流产风险。患有全身性疾病的女性在妊娠前需积极控制基础疾病，将病情稳定在合适状态后再考虑妊娠，并在孕期密切监测病情变化。
