小儿咳嗽发烧的原因包括感染性和非感染性因素。感染性因素有上呼吸道感染（多由病毒或细菌引起，婴幼儿易患）、下呼吸道感染（支气管炎可由多种病原体引起，肺炎病原体因年龄而异）；非感染性因素包括气道异物（3岁以下小儿高发）、过敏因素（接触过敏原致气道过敏反应）、环境因素（空气污浊等刺激）及自身免疫性疾病（少见但可致相关症状）。
一、感染性因素
（一）上呼吸道感染
1.病因及机制：多由病毒引起，如鼻病毒、流感病毒等，也可由细菌感染所致，像溶血性链球菌等。小儿免疫系统发育尚不完善，呼吸道黏膜屏障功能较弱，容易受到病原体侵袭。病毒或细菌感染后，会引发呼吸道炎症反应，刺激呼吸道黏膜感受器，导致咳嗽；同时，病原体在体内生长繁殖过程中释放的毒素等物质会引起体温调节中枢功能紊乱，从而出现发烧症状。例如，有研究表明，在小儿上呼吸道感染病例中，约60%是由病毒感染引起，其余为细菌或支原体等感染。
2.年龄因素影响：婴幼儿相对更易发生上呼吸道感染，因为其鼻腔狭窄、鼻黏膜柔嫩且血管丰富，感染时易出现鼻塞等症状，且自身免疫功能较成人和年长儿更不完善。
（二）下呼吸道感染
1.支气管炎：常由病毒、细菌或肺炎支原体等感染引起。小儿支气管管腔相对狭窄，感染后易发生充血、水肿，导致气道狭窄，引起咳嗽；炎症累及肺部组织时可影响体温调节，出现发烧。例如，肺炎支原体感染引起的小儿支气管炎，在学龄前及学龄期儿童中较为常见，其引发的咳嗽多为刺激性干咳，体温可呈不同程度升高。
2.肺炎：病原体可通过呼吸道吸入、血行传播等途径到达肺部引发感染。小儿肺炎时，肺泡内炎症渗出，影响气体交换，同时炎症刺激会导致咳嗽，而病原体产生的毒素等会引起发热。不同年龄段小儿肺炎的病原体有所差异，新生儿肺炎多由细菌、病毒或衣原体等感染引起，症状可不典型，可出现口吐白沫、呼吸急促等表现，同时伴有发热；婴幼儿肺炎常见病原体为肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌等，临床可见发热、咳嗽、气促等症状。
二、非感染性因素
（一）气道异物
1.病因及机制：小儿好奇心强，喜欢将小物件放入口中，容易发生气道异物吸入。异物进入气道后，会刺激气道黏膜，引起咳嗽反射，试图将异物排出；同时，异物阻塞气道可导致通气障碍，引起机体缺氧，进而可能引发炎症反应导致发热。例如，有案例报道，1-3岁小儿是气道异物的高发人群，异物多为花生米、瓜子等。
2.年龄与性别影响：3岁以下小儿由于咀嚼功能不完善，且喜欢将小物品放入口中，相对更易发生气道异物，性别差异在这方面无明显突出表现。
（二）过敏因素
1.病因及机制：小儿接触过敏原后，如花粉、尘螨、动物毛发等，会引起气道过敏反应，导致气道黏膜水肿、分泌物增多，刺激气道引起咳嗽；过敏反应还可能激活机体的免疫细胞，释放炎性介质，引起体温调节紊乱出现发热。例如，在过敏性咳嗽的小儿中，接触过敏原后咳嗽症状会明显加重，部分患儿可伴有低热。
2.生活方式影响：如果小儿生活在花粉较多的季节或居住环境尘螨较多等，接触过敏原的机会增加，发生过敏相关性咳嗽发烧的概率会升高。
（三）其他非感染性因素
1.环境因素：室内空气污浊、温度过高或过低、空气干燥等环境因素可刺激小儿呼吸道，引起咳嗽，若机体因环境不适导致抵抗力下降，可能继发感染出现发热。例如，冬季室内供暖温度过高且空气干燥时，小儿呼吸道黏膜易受刺激，容易出现咳嗽，部分小儿可能因呼吸道防御功能降低而合并感染发热。
2.自身免疫性疾病：虽然相对少见，但某些自身免疫性疾病也可导致小儿咳嗽发烧，如幼年特发性关节炎等。自身免疫性疾病是机体免疫系统错误地攻击自身组织器官，引发炎症反应，除了出现关节等部位的症状外，也可累及呼吸道等出现咳嗽，同时伴有发热，且发热多为长期低热或中等度发热等。
