孩子夜里咳嗽厉害的原因为上呼吸道感染、下呼吸道感染-支气管炎、下呼吸道感染-肺炎、过敏性鼻炎、过敏性哮喘等。
1.上呼吸道感染
病毒感染是常见原因，如鼻病毒、冠状病毒等。孩子夜间迷走神经相对兴奋，会使呼吸道分泌物增多，刺激呼吸道引起咳嗽。上呼吸道感染除了夜间咳嗽厉害外，还可能有鼻塞、流涕等症状，可伴有低热，一般体温在38℃以下。儿童免疫系统发育不完善，容易受到病毒侵袭引发上感。
2.下呼吸道感染-支气管炎
多由病毒、细菌或支原体感染引起。炎症刺激支气管黏膜，导致分泌物增加。夜间孩子平躺时，痰液可能刺激支气管，加重咳嗽。患儿除了夜间咳嗽，还可能有喘息、气促等表现，小婴儿可能出现呼吸增快，可达40-80次/分钟。支气管炎在冬春季节更易发生，儿童呼吸道解剖结构特点使其易患此类疾病。
3.下呼吸道感染-肺炎
病原体感染肺部，如细菌（肺炎链球菌等）、病毒（流感病毒等）、支原体等。肺炎时肺部炎症导致肺泡和支气管内分泌物增多，夜间咳嗽往往较剧烈。患儿可能有发热、气促、呼吸困难等表现，小婴儿肺炎可能出现口吐泡沫、拒奶等症状。肺炎对儿童健康威胁较大，尤其是婴幼儿，其肺部防御功能较弱。
4.过敏性鼻炎
孩子接触过敏原，如尘螨、花粉等，引起鼻腔黏膜过敏反应，分泌物倒流至咽喉部，刺激咳嗽感受器导致夜间咳嗽。同时可能伴有鼻痒、打喷嚏、鼻塞等症状，常在接触过敏原后发作。儿童接触过敏原的机会较多，家庭环境中尘螨是常见过敏原，若室内卫生不佳、被褥更换不勤等易滋生尘螨。
5.过敏性哮喘
过敏体质的孩子接触过敏原后，气道发生高反应性炎症。夜间气温变化、气道分泌物增多等因素可诱发哮喘发作，出现咳嗽、喘息等症状。哮喘患儿咳嗽多为刺激性干咳，夜间或清晨发作明显，可伴有呼吸困难，呼气延长等表现。
此外，个别孩子可能因情绪紧张、焦虑等心理因素导致夜间咳嗽，但相对较少见。儿童的心理状态可能受环境等多种因素影响，若近期有生活事件变化等情况，可能会出现心理因素相关的咳嗽表现。
