地中海贫血严重时可导致多系统功能衰竭，甚至危及生命，具体表现为贫血加重、器官损伤及并发症风险显著升高。
严重贫血与循环系统损害：重型患者血红蛋白常＜60g/L，长期贫血致心脏代偿性扩大、心肌缺氧，引发活动后气促、下肢水肿，甚至顽固性心力衰竭；骨髓过度造血导致骨骼变形（如头颅增大、额部隆起），压迫神经或造成病理性骨折。
肝脾肿大与器官衰竭：持续溶血使肝脾代偿性增大，长期可引发肝硬化、门静脉高压，甚至消化道大出血；脾脏过度破坏血细胞致血小板减少，增加皮肤瘀斑、牙龈出血等出血倾向；肝脏铁沉积（铁过载）加速肝纤维化，进展为肝功能衰竭。
铁过载与多器官毒性：长期输血或肠道铁吸收增加致铁蓄积，心脏、肝脏、胰腺为主要受累器官。心肌铁沉积可引发恶性心律失常、难治性心衰；胰腺铁过载诱发胰岛素分泌不足，导致青少年生长发育迟缓、糖尿病；肝脏铁沉积进一步加重肝功能障碍。
感染与生长发育障碍：严重贫血致免疫力低下，易并发肺炎、败血症等感染；儿童患者因慢性缺氧、营养吸收障碍出现生长发育迟缓，骨骼发育异常（如身材矮小），青少年期性发育延迟。育龄女性妊娠时贫血加重，增加流产、早产及胎儿宫内窘迫风险。
治疗相关风险与并发症：长期输血依赖者易发生含铁血黄素沉着症；脾切除术后感染风险（荚膜细菌感染）需预防性接种；造血干细胞移植虽为根治手段，但存在移植物抗宿主病（GVHD）、感染、骨髓衰竭等风险。需结合病情规范治疗，如输血、铁螯合剂（如去铁胺）、脾切除或移植。
