手足口病多数患儿症状轻属自限性疾病，一般治疗包括对症支持、休息、清洁通风、清淡饮食及口腔皮肤护理；药物治疗有抗病毒药物（重症可考虑用干扰素α）、对症治疗药物（退热、缓解口腔疼痛等）；重症病例神经系统受累需脱水降颅压等，呼吸循环衰竭要呼吸循环支持；婴幼儿和免疫力低下人群需密切观察、细致护理及个体化治疗。
药物治疗
抗病毒药物：目前对于肠道病毒感染引起的手足口病，尚无特效的抗病毒药物。但对于重症患儿或有重症高危因素的患儿，可在医生评估后考虑使用干扰素α等药物，干扰素α具有抗病毒、免疫调节等作用，能抑制病毒复制，有助于病情恢复。不过，药物的使用需严格掌握适应证和剂量。
对症治疗药物
退热药物：如果患儿出现发热，体温超过38.5℃且伴有明显不适时，可根据患儿年龄等情况选择合适的退热药物，如对乙酰氨基酚等（需注意严格按照药品说明书和患儿具体情况使用，避免超剂量等情况），但要遵循儿科安全护理原则，优先考虑非药物退热方法如物理降温（温水擦浴等）作为初始退热手段，低龄儿童需谨慎使用退热药物。
缓解口腔疼痛药物：对于口腔疱疹、溃疡引起疼痛明显的患儿，可使用康复新液等药物，促进口腔黏膜修复，缓解疼痛。
重症病例治疗
神经系统受累治疗：如果患儿出现神经系统受累表现，如精神差、嗜睡、易惊、头痛、呕吐、肢体抖动、肌无力等，需进行脱水降颅压治疗，常用药物有甘露醇等，同时要保持呼吸道通畅，吸氧，维持内环境稳定等。必要时需进行机械通气等生命支持治疗。
呼吸、循环衰竭治疗：对于出现呼吸、循环衰竭的患儿，要积极进行呼吸支持，如气管插管、机械通气等，同时进行循环支持，使用血管活性药物等维持血压、心率等生命体征稳定。
特殊人群注意事项
婴幼儿：婴幼儿免疫系统发育尚未完善，患手足口病时病情变化可能较快，需密切观察体温、精神状态、呼吸等情况，一旦出现异常需及时就医。在护理方面要更加细致，保持皮肤清洁干燥，避免搔抓疱疹引起感染。
免疫力低下人群：如患有先天性免疫缺陷病、长期使用免疫抑制剂等免疫力低下的患儿，感染手足口病后更容易发展为重症，需要更加严密的监测和积极的治疗干预，医生会根据患儿具体免疫状态制定更谨慎和个体化的治疗方案。
