肛瘘的主要原因是肛周脓肿破溃或切开引流后形成的后遗症，其中80%以上由肛腺感染引发。此外，特异性感染、外伤、先天性发育异常及慢性疾病等也可能导致肛瘘。
一、肛周脓肿继发
1. 肛腺感染机制：肛腺开口于肛窦，粪便残渣易堵塞肛窦并引发炎症，炎症沿肛腺导管扩散至肛周间隙形成脓肿，脓肿破溃后若未彻底清除感染源，会在肛周皮肤与直肠黏膜间形成瘘管。青壮年（20-40岁）是高发群体，因男性肛腺分支复杂且易受粪便污染，男性发病率较女性高2-3倍。
2. 生活方式影响：长期便秘或腹泻导致排便时肛窦反复受损，久坐、饮酒及辛辣饮食使肛周血管充血，降低局部抵抗力；糖尿病患者因免疫力低下，肛周感染形成脓肿的概率是普通人群的2-3倍，且术后愈合能力差。
二、特异性感染因素
1. 结核分枝杆菌感染：多继发于肺外结核，结核杆菌经血行播散至肛周组织，形成慢性感染性瘘管，病程长且反复发作，需联合抗结核药物治疗。
2. 克罗恩病：炎症性肠病累及肛周时，肠道黏膜炎症突破肠壁形成瘘管，患者常伴腹痛、腹泻及体重下降，需同步治疗原发病。
三、外伤与医源性因素
1. 肛周外伤：肛门直肠手术、异物损伤或分娩时盆底组织撕裂，破坏肛周正常结构后感染扩散，可能形成肛瘘。孕妇因孕期腹压增加及产后便秘，肛周组织易受损伤，需注意产后护理。
2. 手术并发症：肛瘘术后若引流不彻底或切口愈合不良，可能继发肛周感染，形成新的瘘管。
四、先天性发育异常
1. 婴幼儿肛瘘：新生儿因先天性肛腺发育异常、肛门直肠畸形等，导致肛腺与肛周皮肤间存在未闭合瘘管，多表现为低位肛瘘，需尽早手术干预。
2. 儿童肛瘘特点：后天性多因尿布性皮炎继发肛周感染，需保持肛周清洁干燥，避免反复刺激。
五、慢性疾病与免疫因素
1. 慢性疾病：长期贫血、营养不良患者免疫力低下，肛周感染后易形成肛瘘，需改善营养状态，增强局部抵抗力。
2. 免疫缺陷：艾滋病患者因免疫功能严重受损，肛周感染风险显著升高，肛瘘治疗难度大，愈合率低，需综合免疫调节。
