肛瘘治疗包括非手术治疗即坐浴等改善症状但无法根治；手术治疗有适低位单纯性肛瘘的瘘管切开术、适低高位单纯性肛瘘可保括约肌的挂线疗法、适低位单纯性肛瘘的肛瘘切除术；特殊人群中儿童手术需谨慎考虑肛门功能影响，老年人术前要全面评估身体状况，糖尿病患者术前严格控血糖术后密切监测护理。
一、非手术治疗
肛瘘非手术治疗主要包括坐浴等方式。可使用1：5000高锰酸钾溶液进行坐浴，通过改善局部血液循环，暂时缓解肛瘘引起的疼痛、肿胀等症状，但非手术治疗无法根治肛瘘，仅能作为辅助缓解症状的手段。
二、手术治疗
（一）瘘管切开术
适用于低位单纯性肛瘘。该方法是将瘘管全部切开开放，依靠肉芽组织生长逐渐愈合。其原理是通过切开瘘管，使创面从底部开始生长，最终达到愈合目的，能有效去除病灶。
（二）挂线疗法
适用于低位或高位单纯性肛瘘。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘。挂线可起到慢性切割瘘管的作用，同时能保护肛门括约肌功能，避免一次性切断括约肌导致肛门失禁。
（三）肛瘘切除术
适用于低位单纯性肛瘘。直接切除全部瘘管及周围瘢痕组织，创面直接缝合或开放让其愈合。此方法能彻底去除病灶，但对于复杂肛瘘可能不适用。
三、特殊人群注意事项
（一）儿童
儿童肛瘘手术需谨慎，要充分考虑对肛门功能的影响。手术时应选择对肛门括约肌损伤较小的术式，术后需密切观察肛门排便功能恢复情况，加强肛周护理，因为儿童肛门括约肌等组织发育尚不完善，不当手术可能影响其未来排便功能。
（二）老年人
老年人身体机能相对较弱，手术前需全面评估身体状况，包括心肺功能、血糖、血压等。若存在基础疾病如糖尿病，需积极控制血糖，因为高血糖不利于伤口愈合，增加术后感染等并发症风险。手术方式选择要兼顾治疗效果与老年人身体耐受性，术后加强护理，预防肺部感染、深静脉血栓等并发症。
（三）糖尿病患者
糖尿病患者肛瘘手术前需严格控制血糖，使血糖处于相对稳定的范围，以降低术后感染等并发症发生的可能性。术后要密切监测血糖，加强创面护理，保持肛周清洁，促进伤口愈合。
