男性阴茎根部疼痛可由多种因素引起，外伤因素包括外力撞击和性生活损伤；感染因素有尿道炎、前列腺炎、附睾炎；结石因素包含尿道结石和膀胱结石；神经因素涉及神经炎和神经过敏；其他因素有阴茎硬结症和精索静脉曲张，不同因素对应不同人群及相关特点。
一、外伤因素
（一）外力撞击
男性阴茎根部受到外力直接撞击，比如性生活中姿势不当、运动时会阴部碰撞到硬物等情况，会导致局部组织损伤，从而引起疼痛。这种情况下，受伤部位可能会有红肿、淤血等表现，不同年龄、性别人群均可能发生，若为儿童在玩耍时发生此类情况需格外重视，应及时就医检查是否有内部组织更严重的损伤。
（二）性生活损伤
性生活过于剧烈、粗暴，可能造成阴茎根部的海绵体、系带等部位损伤，引发疼痛。男性不同年龄段都可能出现，年轻男性性生活较频繁时更需注意方式方法，女性伴侣也应配合以减少此类损伤发生的可能。
二、感染因素
（一）尿道炎
尿道发生细菌、支原体、衣原体等感染时，炎症可能蔓延至阴茎根部附近组织，引起疼痛。尿道炎可发生于各个年龄段男性，不注意个人卫生、有不洁性生活史等情况易诱发，儿童若出现相关泌尿系统感染也可能波及阴茎根部区域。
（二）前列腺炎
前列腺炎症可放射至阴茎根部，引起疼痛。前列腺炎在成年男性中较为常见，尤其是长期久坐、嗜酒、性生活不规律的男性。不同年龄成年男性都有患病可能，老年男性也可能因前列腺增生等基础疾病引发炎症相关的阴茎根部疼痛。
（三）附睾炎
附睾发生炎症时，炎症扩散可能导致阴茎根部疼痛。附睾炎多见于中青年男性，可由细菌感染等引起，如不及时治疗可能影响生育等功能，儿童若出现附睾炎相关情况需考虑特殊的感染途径等因素。
三、结石因素
（一）尿道结石
尿道内存在结石时，结石移动可能刺激阴茎根部附近组织，引起疼痛。各年龄段男性都可能出现，长期饮水少、尿液成分异常等是诱发因素，儿童相对少见但也有因先天等因素导致尿道结石的可能。
（二）膀胱结石
膀胱结石可能通过尿道反射性引起阴茎根部疼痛。膀胱结石多见于老年男性，与前列腺增生等导致尿液潴留有关，儿童也可能因代谢等问题出现膀胱结石情况。
四、神经因素
（一）神经炎
阴茎根部附近的神经发生炎症等病变时，可引起疼痛。如糖尿病患者长期高血糖可能导致神经病变，引发阴茎根部神经痛，各年龄段糖尿病患者均可能出现，老年糖尿病患者更需注意血糖控制以预防神经病变相关疼痛。
（二）神经过敏
精神紧张、焦虑等因素可能导致阴茎根部神经敏感性增加，出现疼痛感觉。不同年龄、性别人群都可能因心理因素出现这种情况，长期精神压力大的人群更易发生。
五、其他因素
（一）阴茎硬结症
阴茎海绵体白膜发生纤维组织增生，形成硬结，可导致阴茎根部疼痛等不适。多见于中年男性，具体病因尚不十分明确，可能与外伤、遗传等因素有关。
（二）精索静脉曲张
精索内静脉回流受阻等原因导致精索静脉曲张，可能引起阴囊、阴茎根部区域的坠胀、疼痛等感觉。多见于青壮年男性，左侧精索静脉曲张更为常见，会影响生育等功能，需及时评估病情。
