男性感染HPV病毒有多种症状表现，包括无明显症状的潜伏感染，还有常见的皮肤黏膜表现如寻常疣、扁平疣、尖锐湿疣，以及可能出现的较为罕见的呼吸道乳头状瘤病。无明显症状的潜伏感染时病毒潜伏人体内部未引起可见病变；寻常疣是黄豆大小等粗糙坚硬丘疹；扁平疣是米粒至黄豆大小扁平隆起丘疹；尖锐湿疣是生殖器部位细小淡红丘疹渐增呈多种外观的性传播疾病表现；呼吸道乳头状瘤病罕见，累及呼吸道黏膜致出现相关症状。
男性感染HPV后，有相当一部分处于潜伏感染状态，即没有任何可见的症状和体征。这是因为HPV病毒在人体内部潜伏，未引起明显的病理改变。例如，一些低危型HPV病毒可能在感染初期就处于这种潜伏状态，病毒在局部组织中存在，但尚未引发可被察觉的病变，此阶段可能持续数周、数月甚至数年，患者自身往往难以发现感染。
常见的皮肤黏膜表现
寻常疣：多表现为黄豆大小或更大的丘疹，表面粗糙，质地坚硬，呈灰褐色或正常肤色，可发生在手部等皮肤部位。这是由于HPV感染皮肤黏膜上皮细胞后，导致细胞异常增生所致。研究表明，特定型别的HPV（如HPV-2等）容易引起寻常疣，一般通过直接接触传播，当皮肤有微小破损时，病毒容易侵入并引发病变。
扁平疣：通常为米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，表面光滑，质硬，呈浅褐色或正常肤色，好发于面部、手背等部位。HPV-3等型别是引起扁平疣的常见病毒类型，其发病与机体免疫状态有关，当机体免疫力较低时，更容易发生扁平疣，比如长期熬夜、过度劳累等导致免疫力下降的男性，就可能增加感染后发生扁平疣的风险。
尖锐湿疣：这是男性感染HPV较为典型且常见的性传播疾病表现。病变初期为细小淡红色丘疹，逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等外观，表面凹凸不平，湿润柔软，易出血。好发于生殖器部位，如阴茎、龟头、冠状沟、肛门周围等。高危型HPV（如HPV-16、HPV-18等）与尖锐湿疣的发生密切相关，尤其是持续感染高危型HPV时，患尖锐湿疣的风险显著增加，且有恶变的可能。尖锐湿疣的传播主要通过性接触，不洁的性行为是重要的感染途径，在性生活中没有采取安全防护措施时，感染风险大大提高。
可能出现的其他情况
呼吸道乳头状瘤病：较为罕见，多发生于婴幼儿及儿童，但成人也可能感染相关HPV亚型后发病。病变主要累及呼吸道黏膜，表现为呼吸道出现乳头状新生物，可引起呼吸困难等症状。不过，男性成人发生呼吸道乳头状瘤病相对少见，其发病机制是HPV感染呼吸道上皮细胞后，导致细胞异常增殖形成乳头状瘤，具体的HPV亚型与呼吸道乳头状瘤病的关系也有相关研究探索，但确切的关联还在不断深入研究中。
