心肌炎病因病毒感染、细菌感染和自身免疫性疾病相关等。
1.病毒感染
病毒是引发心肌炎最常见的病原体，其中柯萨奇病毒B组（如B1-B6型）、埃可病毒、腺病毒、流感病毒等较为常见。病毒侵入人体后，可直接侵袭心肌细胞，导致心肌细胞损伤；也可通过免疫反应介导心肌损伤，例如病毒作为抗原刺激机体免疫系统产生抗体，抗体与心肌细胞表面抗原结合，引发免疫反应，造成心肌炎症。
2.细菌感染
某些细菌感染也可能引发心肌炎，例如白喉杆菌感染，白喉杆菌产生的外毒素可对心肌造成损害；链球菌感染引起的风湿热，也可累及心脏，导致风湿性心肌炎，不过相较于病毒感染，细菌感染引发心肌炎的比例相对较低。
3.自身免疫性疾病相关
一些自身免疫性疾病可继发心肌炎，如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等。在自身免疫性疾病患者中，机体免疫系统存在异常，产生自身抗体攻击自身组织，当心肌组织受到自身抗体攻击时，就会引发炎症反应，导致心肌炎。这类患者往往本身有自身免疫性疾病的基础病史，如系统性红斑狼疮患者可出现面部红斑、关节疼痛等基础表现，同时可能伴随心肌受累引发心肌炎。
