慢性根尖周炎不治疗会带来多方面不良影响，局部病变会加重，炎症扩散可致颌面部蜂窝织炎等，窦道形成反复流脓难消退；全身健康受影响，感染播散可能引发菌血症等，还可能影响心血管系统；牙齿功能会丧失，出现松动甚至脱落，还会累及邻牙影响其健康。
窦道形成：炎症长期刺激会使根尖周组织与口腔黏膜或皮肤相通，形成窦道。窦道会反复流脓，影响口腔卫生和患者的生活质量。而且窦道的存在会持续刺激周围组织，导致炎症难以消退，对于不同年龄的患者，窦道的存在都可能带来心理和生理上的不适，尤其是儿童可能会因为局部的不适而影响进食和情绪。
全身健康受影响
感染播散：慢性根尖周炎的细菌及其毒素等病原体可能进入血液循环，引起全身感染。例如，可能导致菌血症，虽然大多数情况下人体的免疫系统可以清除这些病原体，但对于免疫力较低的人群，如老年人、患有糖尿病等基础疾病的患者，感染播散可能引发更严重的全身感染性疾病，如败血症等，危及生命。老年人本身免疫力相对下降，患慢性疾病较多，感染播散的风险更高；糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体抵抗力差，更容易受到感染播散的影响。
影响其他系统：长期的慢性感染可能对身体其他系统产生不良影响，如心血管系统。有研究表明，慢性根尖周炎可能与一些心血管疾病的发生存在关联，因为细菌感染引发的炎症反应可能会影响血管内皮功能，增加动脉粥样硬化等心血管疾病的发生风险。不同性别在这方面可能没有明显差异，但对于有基础心血管疾病的患者，慢性根尖周炎不治疗可能会加重病情。
牙齿功能丧失
牙齿松动：随着根尖周炎症的持续发展，牙槽骨不断被破坏，牙齿的支持组织逐渐减少，牙齿会出现不同程度的松动。当松动达到一定程度时，牙齿就无法正常行使咀嚼功能，最终可能导致牙齿脱落。对于儿童患者，牙齿松动可能会影响其咀嚼和颌骨的正常发育，因为儿童的颌骨还在生长发育阶段，牙齿的缺失或松动可能会导致咀嚼力不均衡，影响颌骨的正常形态和功能发育。
邻牙受累：一颗牙齿患有慢性根尖周炎不治疗，可能会影响相邻牙齿的健康。炎症可能会波及邻牙的根尖周组织，导致邻牙也出现根尖周炎，进而影响多颗牙齿的功能，增加治疗的难度和患者的痛苦。无论是儿童还是成人，邻牙受累都会对口腔的整体健康产生不利影响，儿童可能会因为多颗牙齿的问题而影响口腔的正常功能和美观，成人则可能会因为多颗牙齿需要治疗而增加经济和时间成本。
