肌肉疼痛由多种因素引起，包括运动过量或方式不当致乳酸堆积、肌肉拉伤、感染性疾病（如流感病毒感染）、自身免疫性疾病（如类风湿关节炎）、营养缺乏（如缺乏维生素D）、神经系统疾病（如坐骨神经痛）、药物副作用（如他汀类药物），不同因素在不同年龄段人群中的发生情况有差异，如儿童易因流感感染肌肉疼痛，老年人易因多种因素出现相关情况等。
一、运动相关因素
运动过量或运动方式不当是常见原因。例如，突然进行高强度的无氧运动，如短跑、力量训练等，肌肉在短时间内会产生大量乳酸，堆积在肌肉组织中，刺激神经末梢引起疼痛。对于经常运动的人群，若运动强度突然增加，就容易出现这种情况；而对于平时缺乏运动，偶尔运动的人，更易因运动引发肌肉疼痛。
二、肌肉拉伤
肌肉拉伤多发生在剧烈运动过程中，如快速的伸展、收缩动作超出了肌肉的承受范围。例如在篮球运动中，运动员突然的急停、变向可能导致腿部肌肉拉伤。不同年龄段的人都可能发生肌肉拉伤，年轻人由于运动强度较大相对更易出现，但老年人肌肉弹性等功能下降，也有发生肌肉拉伤的可能，只是概率相对较低。
三、感染性疾病
某些感染性疾病也可能引起肌肉疼痛，如流感病毒感染。流感病毒感染人体后，会引发全身炎症反应，导致肌肉酸痛。儿童由于免疫系统发育不完善，在流感流行季节更容易因流感病毒感染出现肌肉疼痛；成年人在身体免疫力低下时也可能感染流感病毒出现相关症状。
四、自身免疫性疾病
像类风湿关节炎，它是一种自身免疫性疾病，会累及关节周围的肌肉组织，导致肌肉疼痛、僵硬等症状。这种疾病在各个年龄段都可能发生，女性相对男性更易患类风湿关节炎，发病机制与自身免疫系统错误攻击自身组织有关。
五、营养缺乏
缺乏某些营养物质也会引起肌肉疼痛，例如缺乏维生素D。维生素D对于钙的吸收和利用至关重要，缺乏维生素D会影响肌肉的正常功能，导致肌肉疼痛。老年人由于皮肤合成维生素D的能力下降，且饮食中维生素D摄入可能不足，更容易出现维生素D缺乏相关的肌肉疼痛；儿童如果饮食中维生素D摄入不足，也可能影响肌肉健康引发疼痛。
六、神经系统疾病
一些神经系统疾病会导致肌肉疼痛，如坐骨神经痛。坐骨神经受到压迫或损伤时，会引起下肢放射性的肌肉疼痛。不同年龄段均可发生，中老年人由于腰椎退变等原因更容易出现坐骨神经受压的情况引发肌肉疼痛；年轻人可能因腰椎外伤等因素导致坐骨神经痛。
七、药物副作用
某些药物可能有肌肉疼痛的副作用，如他汀类药物。部分服用他汀类药物的患者可能会出现肌肉疼痛的不良反应。老年人由于可能同时服用多种药物，药物相互作用的风险增加，更需关注药物副作用导致的肌肉疼痛情况；不同性别服用他汀类药物出现副作用的概率在一般人群中无明显性别差异，但个体对药物的反应可能不同。
