导致精子少的因素众多，包括精索静脉曲张、感染、下丘脑-垂体-性腺轴功能异常、染色体异常、自身免疫因素等。
1.精索静脉曲张
这是导致精子少常见的原因之一。精索内静脉回流受阻，造成局部温度升高，有毒物质积聚等，影响睾丸的生精功能，使得精子数量减少。例如相关研究表明，约有39%的男性不育症是由精索静脉曲张引起，其中相当一部分表现为精子数量减少。
2.感染
附睾炎、前列腺炎、精囊炎等生殖系统的感染性疾病会影响精子的生成和存活。病原体产生的毒素等物质会损害生精上皮，干扰精子的发生、发育和成熟过程，从而导致精子数量减少。比如，附睾炎可使附睾管腔狭窄，影响精子输出，同时炎症还会影响睾丸的生精功能。
3.下丘脑-垂体-性腺轴功能异常
下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）、垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）以及性腺分泌的性激素之间的调节失衡都会影响精子生成。例如，垂体瘤等疾病可能导致FSH和LH分泌异常，进而影响睾丸生精；甲状腺功能亢进或减退、肾上腺皮质功能亢进或减退等内分泌疾病也会通过影响性激素水平间接影响精子生成，导致精子数量减少。
4.染色体异常
如克氏综合征，患者的染色体核型为47，XXY，其睾丸发育不全，生精功能障碍，精子数量明显减少。相关遗传学研究发现，一些特定的染色体结构或数目异常会干扰精子发生的相关基因表达，导致精子生成障碍。
5.自身免疫因素
男性自身产生抗精子抗体，这些抗体可作用于精子的不同部位，如精子头部、尾部等，影响精子的活力、运动能力甚至导致精子凝集，从而影响精子数量和质量。例如，附睾炎、睾丸炎等疾病后，机体的免疫系统可能会错误地将精子识别为外来异物，产生抗精子抗体。
一些慢性疾病，如糖尿病，会影响血管和神经功能，进而影响睾丸的血液供应和内分泌功能，导致精子数量减少；高血压等疾病也可能通过影响全身的血液循环，间接影响睾丸的生精环境。
