甲氨蝶呤可致血液系统出现白细胞、血小板减少等致感染出血风险，消化系统有恶心呕吐等反应，肝脏可致肝酶升高等损害，肾脏大剂量或肾功能不全时可现损害，生殖系统影响男性精子、女性月经及致胎儿畸形，皮肤有皮疹等反应且易增加感染风险，儿童用需谨慎，老年人易蓄积需监测调整，肝肾功能不全者要遵医嘱调整剂量监测。
一、血液系统副作用
甲氨蝶呤可抑制骨髓造血功能，常见白细胞、血小板减少，导致感染风险增加（如易患呼吸道感染等）、出血倾向（表现为皮肤瘀点、瘀斑，鼻出血等），严重时可能出现全血细胞减少。研究表明，长期或大剂量使用甲氨蝶呤的患者，血液系统抑制的发生率相对较高，这与药物对骨髓细胞DNA合成的抑制作用相关。
二、消化系统副作用
多数患者使用甲氨蝶呤后会出现消化系统反应，常见恶心、呕吐，部分患者还可发生口腔溃疡、腹痛、腹泻等。这是因为药物刺激胃肠道黏膜，影响胃肠道正常的消化吸收功能，一般在用药后较短时间内出现，且个体差异存在，部分患者反应可能较为明显。
三、肝脏系统副作用
长期使用甲氨蝶呤可能对肝脏造成损害，引起肝酶升高，甚至导致肝纤维化、肝硬化等。有研究显示，慢性肝病患者使用甲氨蝶呤时，肝脏不良事件的发生风险可能增加，这与药物在肝脏代谢过程中对肝细胞的毒性作用有关。
四、肾脏系统副作用
甲氨蝶呤经肾脏排泄，大剂量使用或患者肾功能不全时，可能出现肾功能损害，表现为肌酐清除率下降等。例如，肾功能不全患者使用甲氨蝶呤需谨慎调整剂量，因为药物排泄受阻易在体内蓄积，加重肾脏负担。
五、生殖系统副作用
对于男性患者，甲氨蝶呤可能影响精子生成，导致精子数量减少、活力降低；对于女性患者，可能引起月经紊乱，且妊娠女性使用该药物可能导致胎儿畸形，因此备孕或妊娠期女性需严格避免使用甲氨蝶呤。
六、皮肤系统副作用
部分患者使用甲氨蝶呤后会出现皮肤反应，如皮疹、瘙痒等，皮疹形态多样，可为红斑、丘疹等，一般在用药后数天至数周内出现，严重时可能影响患者生活质量。
七、感染风险增加
由于甲氨蝶呤抑制免疫系统功能，患者使用后机体抵抗力下降，更容易发生各种感染，包括细菌、病毒、真菌等感染，且感染症状可能不典型，需密切关注患者感染相关表现。
特殊人群注意事项
儿童：低龄儿童使用甲氨蝶呤需格外谨慎，因儿童器官发育尚未成熟，药物副作用对儿童的影响可能更显著，应严格评估用药获益与风险，优先考虑非药物干预措施。
老年人：老年人肝肾功能减退，使用甲氨蝶呤时更易发生药物蓄积，需密切监测肝肾功能及血液学指标，根据个体情况调整用药方案。
肝肾功能不全者：此类患者使用甲氨蝶呤时，药物代谢及排泄受影响，发生副作用的风险升高，应在医生指导下调整剂量，并加强相关指标监测。
