厌氧菌感染有局部和全身症状，不同部位感染有特殊表现，儿童和老年人感染症状有特点。局部症状如皮肤软组织感染有红肿热痛及带臭味脓液，口腔感染有牙龈红肿出血等；全身症状有发热、乏力食欲减退等；腹腔感染有腹膜炎表现，盆腔感染有下腹痛等，肺部感染有咳嗽咳痰等；儿童症状不典型，老年人症状隐匿且易被忽视，多伴基础疾病影响预后。
口腔感染：口腔厌氧菌感染较为常见，如牙周炎，患者会出现牙龈红肿、出血、牙周袋形成，有脓性分泌物溢出，伴有口臭，这是由于口腔内厌氧菌繁殖，破坏牙周组织并产生有异味的代谢产物。
全身症状
发热：部分厌氧菌感染患者会出现发热，体温可在38℃~39℃左右，也有少数患者体温更高。这是因为病原体侵入人体后，人体的免疫系统被激活，释放致热原引起体温调节中枢紊乱导致发热。例如腹腔内厌氧菌感染引发腹膜炎时，患者多有发热表现。
乏力、食欲减退：感染后身体处于应激状态，患者常感到全身乏力，活动耐力下降，同时食欲减退，不想进食。这是由于感染引起的全身炎症反应，影响了机体的代谢和消化功能。比如严重的盆腔厌氧菌感染患者，会出现明显的乏力感，进食量明显减少。
不同部位厌氧菌感染的特殊表现
腹腔厌氧菌感染：可引起腹膜炎，除了有发热、腹痛等表现外，腹痛多为持续性胀痛，疼痛较为剧烈，且伴有恶心、呕吐等症状。腹部查体可有压痛、反跳痛和肌紧张等腹膜刺激征表现。通过腹腔穿刺可抽出带有臭味的脓性液体。
盆腔厌氧菌感染：女性患者盆腔厌氧菌感染常见于盆腔炎等疾病，可出现下腹部疼痛，疼痛可放射至腰骶部，伴有阴道分泌物增多，呈脓性且有臭味，部分患者可出现月经紊乱。若感染严重，可引起盆腔脓肿等并发症，表现为下腹部可触及包块，有压痛。
肺部厌氧菌感染：多与吸入有关，患者可出现咳嗽、咳痰，痰液多为脓性，有恶臭气味，可伴有发热、胸痛等症状。胸部影像学检查可见肺部炎症浸润影，若形成肺脓肿，可见空洞及液平面。
特殊人群的厌氧菌感染症状特点
儿童：儿童厌氧菌感染时，症状可能不典型。例如儿童口腔厌氧菌感染，可能仅表现为牙龈轻度红肿，易被忽视，随着病情进展才会出现明显的化脓等表现。儿童腹腔厌氧菌感染时，发热可能不规律，腹痛表现也不如成人典型，常以哭闹等非特异性表现为主，需密切观察。
老年人：老年人厌氧菌感染时，全身症状可能相对不明显，发热程度可能较低，乏力等表现更易被认为是衰老的正常表现而被忽视。但局部感染症状可能较为隐匿，如肺部厌氧菌感染，咳嗽、咳痰等症状可能较轻，容易延误诊断。同时老年人多伴有基础疾病，如糖尿病等，会影响感染的病程和预后，使感染更难控制。
